ref #10072, ref #9359, ref 10095 remove slf4j-nop from cdmlib

ref #10072 adapt integration test parameter name for log4j as it seems to be incorrect and switch from properties to log4j.xml there

ref #9359 javax.el-api from dependency management as it is not used anymore

ref #10072, ref #9359 fully remove LoggingConfigurer as it is not adaptable to log4j2 and not used anymore (cont.)

ref #10072, ref #9359 fully remove LoggingConfigurer as it is not adaptable to log4j2 and not used anymore

ref #9359 upgrade to 3.0.6 for mariadb-java-client in cdmlib

cleanup

ref #10072 change log4j.properties to log4j.xml in remaining cdmlib modules

ref #10072 change log4j.properties to log4j.xml in commons, model, persistence and services

cleanup

ref #10072, ref #9359, ref #10095  remove commons-logging from xmlgraphics.fop

javadoc

ref #10072, ref #9359, ref #10095  remove commons-logging from unitils-core and commons-beanutils

ref #10072 use log4j for slf4j in cdmlib-commons already

ref #10072, ref #9359, ref #10095  replace commons-logging by jcl-over-slf4j (cont., move jcl-over-slf4j to cdmlib-commons)

ref #10072, ref #9359, ref #10095  replace commons-logging by jcl-over-slf4j and adapt some loggers to log4j

cleanup

remove lifecycle mapping for cdmlib-cache

ref #10095, ref #9359 upgrade and synchronize fasterxml versions

cleanup and javadoc

ref #10095, ref #9359 remove javax.activation-api, jaxb-api and xalan from classpath (replaced by jakarta versions)

ref #10095 add fixed version for jackson-datatype-jsr310

cleanup

ref #9359 add version number for commons-pool to avoid multiple versions in cdmserver comming from remote-webapp and vaadin (though unclear why vaadin retrieves a higher version)

first test B

ref #10072 comment usage of log4j12 in LoggingConfigurer and cdmlib-io in general (last log4j12 in cdmlib)

ref #10072 remove log4j12 from cdmlib-io except for LoggingConfigurer issue

move NoDuplicateNamesValidator to api.validation package to split service layer from other modules, see also last commit

cleanup

move CdmApplicationUtils to real persistence package to avoid multiple scanning with service layer

cleanup

ref #10072 remove log4j12 from remote

cleanup

cleanup

ref #10072 use log4j2 in slf4j

cleanup

avoid cookie error log on cnn

ref #10094 preliminary disable  001-cdm.h2.sql (maybe a java11 issue in jenkins) (cont.)

ref #10094 preliminary disable  001-cdm.h2.sql (maybe a java11 issue in jenkins)

fix incorrect uuid in HomotypicGroupTaxonComparatorTest

cleanup

cleanup and remove debugging in PolytomousKeyGeneratorTest

further changes for debugging

add java version check to DdlCreator

ref #10072 temporarily revert log4j.properties

ref #10072 switch off security manager for DdlCreator

cleanup

ref #10093 adding very first classes copied from cdmlight for docx4j output

ref #10092 deproxy feature for FdG import

cleanup

cleanup

ref #10072 temporarily rename log4j.xml

cleanup

ref #10092 adapt markup import to FdG requirements (fixing errors)

cleanup

ref #10072 change cdmlib-commons log4j.properties to log4j2  log4j.xml

cleanup

fix #10090 revert init strategy and catch LIE in getCollectorTitleCache()

fix #10090 add secsource reference author to the PolytomousKeyNode init strategy

cleanup

cleanup

ref #10090 catch LIE in Team.getCollectorTitleCache

cleanup

ref #10091 show stacktrace only if debug parameter is added

ref #10089 adapt json mapping to new TypeDesignationSet handling (cont.)

cleanup

fix #10091 Add stacktrace to JSON repsonse

ref #10089 return JSONNull for null values in type designation value processor

cleanup

cleanup

ref #10089 handle null values for map and type designation value processor

ref #10089 handle RegistrationDTO with TypedEntityReference again in cdmlib

ref #10089 adapt json mapping to new TypeDesignationSet handling

cleanup

ref #10090, ref #10089 try to avoid LIE in TypeDesignationSet

cleanup

fix #10089 final fixes for TypeDesignationSet formatting ordered by type status (cont.)

fix #10089 final fixes for TypeDesignationSet formatting ordered by type status

cleanup and support for orderedBy and factory methods for TypeDesignationSetContainer

cleanup

ref #10089 implement TypeDesignationSetContainer ordered by status not field unit

cleanup

cleanup and rename RegistrationValidationException to TypeDesignationSetException (cont.)

cleanup and rename RegistrationValidationException to TypeDesignationSetException

minor

ref #10089 rename TypeDesignationSetManager to TypeDesignationSetContainer in cdmlib

ref #10089 rename TypeDesignationWorkingSet to TypeDesignationSet in cdmlib

ref #10089 remove TypedEntityReference from TypeDesignationWorkingSet

make TypeDesignationWorkingSet a decorator and not inherit directly from LinkedHashMap

replace LinkedHashMap by Map where possible

cleanup

ref #10087 make placement source and placement source FK explicit columns and refactor test (also ref #10081 )

ref #10087 make placement source and placement source FK explicit columns and refactor test (also ref #10081 )

ref #10081 add secundum name used in source to cdmlight

cleanup

ref #10087 add taxon node source to status notes in cdmlight

cleanup

ref #10067 cleanup CdmModelCacher

ref #6696 write model cache to target and use compile phase

add ehcache to cdmlib-cache