smaller changes for abcd import

revert adding error log

minor

minor

ref #6166: import siblings if an specimen and smaller changes in ABCD
import

ref #4866 Fix transient object exception

 - fixed typo

 ref #5449 Imporvements for CSV export

 - Fix initialization problems
 - Correctly match taxon name to chosen classification
 - allow export for single leaf node

ref #4866 Test for first implementation for clone classification

ref #4866 Create new description set when cloning taxon (avoid
HibernateException)

ref #4866 First implementation for clone classification (including test)

fix #6174: isDeletable needs to be called with UUID and the objects is
loaded on server side

ref #5458 Add classification filter to service method

fix media deletion

ref #5458 Added find-by-titleCache method for taxon node service

abcd import: association type living culture is a parent child relation

ref #2380 Implement service for getting parent of
UuidAndTitleCache<TaxonNode>

 - parent of either ITaxonTree or UuidAndTitleCache<TaxonNode>
can be retrieved
 - added JUnit test and test file

ref #2380 Implement service for getting children of
UuidAndTitleCache<TaxonNode>

 - direct children of either ITaxonTree or UuidAndTitleCache<TaxonNode>
can be retrieved
 - added JUnit test

fix #4453 Enhance portal visualization of molecular data

  - used DefinedTerm constants for UUIDS
  - used titleCache for all DerivedUnits
  - move string representations to portal code

add test for ermIdInVocabularyComparator

fix TermIdInVocabularyComparator

move taxonnode needs to save old parent and child node

ref #5972: add service method to get count of referencing objects

enabling http POST for a couple of name catalogue controller methods

childNode needs to be saved in TestService to fix the editor test

set test to ignore, create ticket to fix this.

fix failing test

minor

ref #6099: removing cascading to child nodes and adapting the service and persistence layer

ref #5431: the type designation blocks the name deletion only if it is the type name

fix #6127 handling case the taxon has no LSID, avoid NPE in NameCatalogeController

IDE launcher config cdmlib-remote-webapp-unit-test

relaxing web service access restrictions

ref #6118 OAuth2 ready for production
    - removing development setup
    - UserController to return details on the authenticated principal

ref #6118  working test implementation of OAuth2
   - grant types 'implicite', 'authorization_code' tested and working
   - /manage/ service protected (OK for production)
   - /classification/ endpoint restricted for testing only

ref #6118 OAuth2 AuthorizationServer implemented

rel #6118 switching from xml to java based web security configuration

cleaning indent

ref #5972: add method to count referencing objects

minor

ref #5499 add some markerType methods

fix #6122 fix signature issue

fix #6122 add titleCache service to remote

Use abstract controller for identifiable controllers

Create and rename Identifiable(List)Controllers

fix #6122 add titleCache service

fx #6119 Implement uuidAndTitleCache remote services

fix #6120 Cleanup uuidAndTitleCache methods

Minor cleanup

add missing changes

minor

specimen import/search changes

delete system.out.println from test

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/4.3.0'

updating poms for branch'release/4.3.0' with non-snapshot versions

updating poms for 4.4.0-SNAPSHOT development

Rename doPageChildNodes

ref #6065 improved Pager handling

ref #6065 improved Pager handling and pager exception handling

ref #6065 Handle synonyms in taxonInContext

Cleanup

ref #6065 fix NPEs in classification service

ref #6065 fix NPE in pageSize/limit

ref #6065 fix NPE in pageSize

ref #6065 fix page size and add marked ancestors

ref #6065  fix missing taxonUuid in URL

ref #6065  first implementation of taxonInContext service

cleanup

further refactor FindByIdentifierDTO and FindByMarkerDTO

rename FindByIdentifierDTO and FindByMarkerDTO

Revert "fix #6037 per batch transction commit implemented for excel imports"

This reverts commit 53067226137bd8528e6bc26f21edbf98aebe26a9.

ref #6066 rename childNodes to childNodesByTaxon in ClassificationController

ref #6066 add getChildNodes to classification service

ref #6087 adding orderINdex to TermDTO

ref #6066 fix Index out of bound exception

fix #6061: search in titlecache and nomenclatural titleCache in getUuidAndAbbrevTitleCache

fix failing IPNI Service Test

revert tests

Ignore service test

ref #6072 test missing entity in webservice

ref #6072 test missing entity in webservice

ref #6072 set defaults to false and hardcode includeEntity to true for debugging

ref #6072 fix signature issue in remote (2nd try)

ref #6072 fix signature issue in remote

ref #6072 fix compilation issue in IIdentifiableEntityService

Cleanup

fix #6072 Implement findIdentifiableEntityByMarkers

ref #6089 Remove failing irrelevant test

ref #6089 Remove all calls and methods for taxonomicChildrenCount and taxonomicParentCache

Cleanup; Delete unnecessary test classes.

fix #6066 Implement doPageChildNodes with doSynonyms

Clean up

Adapt failing test in NonViralNameParserImplTest

ref #6086 solving the problems in the java-script of the web application monitor widget:
    - chunk information: number rounded and label renamed
    - Percentage number rounding fixed

ref #6086  fix failing test

rel #6086 Improve rounding for progress monitor

 * fix error in rounding by using round not ceil
 * add method for user defined scaled rounding

some cleanup

fix #5837: search on abbrevTitleCache instead of abbrev title