change logging for languageReference inconsistencies bugfix

check language reference integrity

added FIXME for missing named area vocabulary

change logging for languageReference inconsistencies

include "unknown" as language

bugfix for empty regionFks

check for RefDetail and RelPTaxon Notes

minor

minor

consistent representation for AZO and AZO-OO and SUR and SUR-OO

first step to refactor SDD import for large datasets

first step to refactor SDD import for large datasets

minor

dopping unique indexes for StateData and StatisticalMeasurementValue - modifiers  (#2025) and changing OneToMany -> ManyToMany for StatisticalMeasurementValue - modifiers (#2175)

minor

minor

minor

Removed DefinedTermBase.media OneToMany #560 (forgot to delete this line before)

removed FIXME for ManyToMany  #560

Changed DefinedTermBase.media form OneToMany to ManyToMany  #560

Fixes an issue where update of title caches did not work for cloned instances.

Use workingSet in SDD import  #2163

getComponentBeanName public and static

minor

minor

minor

Corrected the javadoc for putText(String, Language)

Failing tests set to ignore

updated javadoc for TextData.putText(XXX), #1515

javadoc for TaxonNameBase.clone()

Added clone() to all TaxonNameBase classes (including some descriptive and common classes). #2170

Refactoring of taxon business logic methods and started to write tests for these methods. The tests are far from finished.

adding taxontree id to the acceptedtaxa web service

remove compareTo in NamedArea and changed according tests

bugfix for cache updating hybrid flags

newInstance method for User

minor

add biliography to BM namefact categories

hybrid parsing and caching for monom, binom and trinom flags implemented

bugfix for partitioned deduplicate

use transformer for Cyprus and make base classes more generic for transformers

added PresenceTerm to transformers

marker type "endemic" and features "status" and "systematics" in cdmlib-persistence

marker type "endemic" and features "status" and "systematics" in cdmlib-model

latest changes for cyprus import

Deleted tests used for natural language and identification keys.

Last changes

Deleted tests used for natural language and identification keys.

Set up of the objects for the tests

ignore web accessing tests

openURL service wrapper implementation

minor fix

fixed setBarcode #2164

Created a test for the setBarcode method

minor

forget the ignore, it's getting too late :)

the test data did not make much sense before

Created a test to illustrate #2161

reference.uri from String to java.net.Uri (#2150)

Added new rank "unranked" (#2141) and updated language labels and titleCaches with full language name (#2144)

bugfix for term updates in imports that do not have a surrounding transaction

bugfix for long values in BMFacts

Fixed some problems in the point class

bugfix for jaxb annotation on isHashMapHibernateBugFixed

Implemented a uuidAndTitleCache method for institutions

Improved uuidAndTitleCache methods of ITaxonService

Corrected inheritance of interfaces. Corrected the message string of an exception.

Corrected the inheritance of service configurators

fixing test for release 3.0

move IdentificationKeyGenerator to cdmlib-model

Added comments

bugfix for language test

fixed compile errors in SDDDocumentBuilder

minor changes to progress monitor call locations

Added a new match mode. With the existing match modes it was impossible to perform an inexact search (i.e. like) and definging wildcards yourself.

Also fixes #1381

Update concerning the tests (compatibility with the new model)

implemented a method to move synonyms between taxa

added a test case for polytomous keys

Language representations label does hold a human readbale string now instead of an abbreviated label.

added PolytomousKey_TaxonBase to persistence .dll

Implemented missing isProtectedTitleCache method

added an interface to easily identify multilanguage text entities

make labelWithLevel public

javadoc

labelWithLevel() added to NamedArea

bugfix for missing level info in geo service

refining identificationKeyGenerator (only syntax issues and test class etc.)

minor

see comment for r10945

taking over class from IdentificationKeyGenerator2:
Email Maxime:
Dear Andreas,
as you expected, there were several conflicts between your file and mine, I didn't see it at first because I had had some troubles updating the trunk in the morning and I ended with a pretty messy file. So what I did was to use my original file and I tried to make the changes manually: I named it IdentificationKeyGenerator2. I didn't have much time to check if everything was working well, however I plan to come back to work next week so if you could tell me if there are some errors left I could fix this next week and finish commenting the code in the same time.
All the best Maxime

compile errors in descriptionServiceImpl -> Needs to be fixed by Maxime (2)

compile errors in descriptionServiceImpl -> Needs to be fixed by Maxime

include uuid in KeyStatements (25_30 updater)

Identification key generator using Polytomous keys.

Last updates for natural language generation (added comments, new options, cleaned the code, etc)

Few modifications for tests

Last updates for natural language generation (added comments, new options, cleaned the code, etc)

Few modifications for tests

solves a bug that led to strange behavior in the editor's taxon navigator

merge 3.0.2 to trunk