EDIT

$(function(){

  $('#search-input').on("input", function(){

    let text = $( this ).val();

    if(text.length > 3){

      let regex = new RegExp(text);

      let nodes = cy.filter( function(element, i){

        return element.isNode() && element.data("label").match(regex) !== null;

      });

      nodes.select();

      cy.fit(nodes);

    } else {

      cy.collection().select();

      cy.fit();

    }

  });

});