EDIT: Issueshttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/redmine/favicon.ico?14691914852023-02-01T16:38:41ZEDIT Project Management
Redmine feature request #10240 (Closed): Improve DOI formatting for referenceshttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/102402023-02-01T16:38:41ZAndreas Müller
<p>AM:</p>
<p>im Kontext der Flora von Griechenland kommt gerade eine Frage zur Formatierung von DOI Angaben bei Referenzen auf.</p>
<p>Folgender Fall: Die frisch erschiene 1. PDF der Flora of Greece Volume 1 (<a href="https://doi.org/10.3372/fog.v1.arec.ed1">https://doi.org/10.3372/fog.v1.arec.ed1</a>) gibt als recommended citation folgendes an:</p>
<p>Turland N. J. 2023: Arecaceae (ed. 1). – In: Flora of Greece Editorial Committee, Flora of<br>
Greece Volume 1. – Hellenic Botanical Society and Botanic Garden and Botanical Museum<br>
Berlin. <a href="https://doi.org/10.3372/fog.v1.arec.ed1">https://doi.org/10.3372/fog.v1.arec.ed1</a> </p>
<p>Daraus ergibt sich die Anforderung, dass Referenzen mit DOIs so formatiert werden sollten, dass die DOI mit im Zitat erscheint. Bislang machen wir das noch nicht so, sondern verlinken lediglich mit einem Symbol auf die DOI:</p>
<p><img src="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/attachments/download/2269/clipboard-202302011737-26mfd.png" alt="" /></p>
<p>Andreas K. war wohl der Meinung, dass die Verlinkung über Symbol eher die zukunftsweisendere ist. Wenn ich allerdings <a href="https://www.firmennest.de/unkategorisiert/externe-links-kennzeichnen-fuer-usability/">https://www.firmennest.de/unkategorisiert/externe-links-kennzeichnen-fuer-usability/</a> lese oder mit Wikipedia anschauen, denke ich eher, dass in diesem Fall eher angesagt ist, sowohl die DOI anzugeben als auch das Symbol (bzw. das Symbol für externe Links <br>
<img src="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/attachments/download/2270/clipboard-202302011738-dmvcq.png" alt="" /><br>
) und beides zu verlinken.</p>
<p>Zu klären wäre also erstmal, ob</p>
<p>• die DOI grundsätzlich immer als Volltext angezeigt werden soll<br>
• wenn ja, was mit besonders langen DOIs passiert, also soll es eine bestimmte Anzahl Zeichen geben ab dem ein Truncating stattfindet?<br>
• ob zusätzlich das Symbol für externe Links mit verwendet werden soll<br>
• wenn beide, ob auch beide verlinkt sein sollen<br>
• ob das für online- und printpublication gleichermaßen gilt<br>
• ob es konfigurierbar sein soll je nach Projekt</p>
<p>====</p>
<p>Nak:</p>
<p>ich finde die Formatierung mit der DOI wie in dem Flora of Greece Beispiel besser, so mache ich das auch in der Bibliographie für Caryophyllales (manuell) und verlinke mit der DOI.<br>
Für Print-Publikationen ist das auch sehr nützlich.</p>
<ul>
<li><p>die DOI grundsätzlich immer als Volltext angezeigt werden soll</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>ich finde, ja</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
<li><p>wenn ja, was mit besonders langen DOIs passiert, also soll es eine bestimmte Anzahl Zeichen geben ab dem ein Truncating stattfindet?</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>da bräuchten wir vielleicht ein Beispiel</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
<li><p>ob zusätzlich das Symbol für externe Links mit verwendet werden soll</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>das wäre vielleicht gut, wenn es keine DOI ist, sondern eine URL</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
<li><p>wenn beide, ob auch beide verlinkt sein sollen</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>Ich würde sagen, wenn DOI, dann ist die verlinkt, ohne zusätzliches Symbol</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
<li><p>ob das für online- und printpublication gleichermaßen gilt</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>für print ist das auch sehr nützlich</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
<li><p>ob es konfigurierbar sein soll je nach Projekt</p>
<blockquote>
<blockquote>
<p>wir könnten uns für ein Default entscheiden, und es kann konfigurierbar sein</p>
</blockquote>
</blockquote></li>
</ul>
<p>NoK:</p>
<p>ich teile die Meinung von Nadja zu den angefragten Punkten</p>
<p>WGB:</p>
<p>ich bin übrigens dafür, die DOI als Link anzugeben, wenn das möglich ist, also ohne Symbol.</p>
<p>WHK:</p>
<p>die Ausgabe der DOI-URI finde ich aus user Sicht wichtig, da sie zur weiteren Recherche kopiert werden kann. Häufig sehe ich Links, die nicht funktionieren oder bei denen der Zugriff beschränkt ist. Deshalb würde mir ein Symbol nicht reichen.<br>
Inzwischen habe ich References nach dem Turland-Bespiel in so vielen Journals gefunden, dass ich davon ausging, dass das fast so etwas wie ein Standard ist.</p>
bug #9979 (In Progress): Flora Greece shows large images https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/99792022-03-15T08:39:27ZAndreas Müller
<p>though medium and small exist and seem to have correct metadata.</p>
<p>E.g. Achillea setacea <a href="https://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/taxon/8e75f1a8-e7f9-4e3e-9ccd-98216a59e7cd">https://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/taxon/8e75f1a8-e7f9-4e3e-9ccd-98216a59e7cd</a> </p>
bug #9379 (Closed): exclude disabled classifications from advanced taxon search formhttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/93792021-01-11T13:37:34ZAndreas Kohlbecker
<p>Classifications which are disabled in the <code>admin/config/cdm_dataportal/settings</code> are to be excluded from the advanced search form.</p>
<p>Example:</p>
<p><a href="http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/admin/config/cdm_dataportal/settings">http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/admin/config/cdm_dataportal/settings</a> : The classification "Centaurea" is disbaled but listed here <a href="http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/search">http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/search</a> </p>
bug #9357 (New): Advanced search shows selection for all classification even if only 1 classifica...https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/93572020-12-11T07:20:16ZAndreas Müller
<p>In the flora of Greece dataportaal only the classification "Vascualar plants of Greece" should be shown</p>
<p><img src="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/attachments/download/1979/picture299-1.png" alt="" /></p>
<p>However, in the advaced search one can choose between the above classification and the Centaurea classification.</p>
<p><img src="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/attachments/download/1980/picture299-2.png" alt="" /></p>
<p>This should not be possible.</p>
bug #9007 (Closed): Enable i18n support for media description UIhttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/90072020-05-08T11:38:41ZAndreas Müller
<p>Currently it shows only English/Default language. If a description is stored in another language this text is not visible and not editable.</p>
task #8934 (Closed): Import new FoG status datahttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/89342020-04-03T10:59:55ZAndreas Müllerbug #7988 (New): Correct formatting and parsing of Reference.editorhttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/79882019-01-14T13:10:55ZAndreas Müller
<p>Currently the "editor" field is not really used for parsing and formatting and also in TaxEditor.</p>
<p>Copied form <a class="issue tracker-6 status-5 priority-10 priority-lowest closed" title="task: Revision of reference type specific properties (Closed)" href="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/7918">#7918</a>: Editor: ok (discuss: person/team atomized?) [same in TaxEditor]</p>
bug #7108 (Closed): supress unwanted sourcetypes in handle_annotations_and_sources()https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/71082017-12-04T15:56:22ZAndreas Kohlbecker
<p>in <code>cdm_create_footnotes()</code> the function <code>_is_original_source_type()</code> is used to suppress unwanted source types, this check should also be used in <code>handle_annotations_and_sources()</code></p>
<p>by this only the following source type will be shown:</p>
<pre> OriginalSourceType::Lineage,
OriginalSourceType::PrimaryMediaSource,
OriginalSourceType::PrimaryTaxonomicSource,
OriginalSourceType::Unknown,
OriginalSourceType::Other,
</pre> bug #7093 (Worksforme): choosing representation which best fits the available size for taxon prof...https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/70932017-11-24T15:48:12ZAndreas Kohlbecker
<p>even fixed in <a class="issue tracker-4 status-5 priority-11 priority-default closed" title="bug: Use media representation which best fits the available size for taxon profile picture (Closed)" href="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/6969">#6969</a> choosing representation which best fits the available size for taxon profile picture not working in all cases</p>
<p>see <a href="http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/taxon/1c7a0a82-bd99-44eb-91cf-77a36206d0ad">http://portal.cybertaxonomy.org/flora-greece/cdm_dataportal/taxon/1c7a0a82-bd99-44eb-91cf-77a36206d0ad</a></p>
<p>where some images are loading slow, in these cases the algorithm chooses the high quality representation even if the thumbnail size perfectly fits the preferred size</p>
<ul>
<li>Thumbnails with 150x96 available (=> product is 14400)</li>
<li>Preferred size 120x120 defined in setting of taxon gallery (=> product is 14400)</li>
</ul>
bug #7092 (Resolved): Adapt dates in Nicks images after mediaCreated became TimePeriodhttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/70922017-11-24T15:08:27ZAndreas Müller
<p>In Flora of Greece.</p>
<p>Correct dates to be found in 20171110_Turland_433_others_59.xlsx </p>
bug #7091 (Closed): Add uri field and abbreviatedText to Righs in supplemental datahttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/70912017-11-24T14:20:52ZAndreas Müller
<p>The current implementation only allows setting of Rights Type, Agent and Text, but not the uri and the abbreviatedText which are also part of the Rights class.</p>
<p>In general we also need a bulk editor for rights, but this is a separate issue.</p>
<p>NOTE: Maybe we need uri and abbreviatedText only for rights of type "licence", as only those show uri and abbrevText in the data portal currently.</p>
feature request #6703 (Closed): Improve title handling for media in dataportalhttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/67032017-06-07T15:04:12ZAndreas Müller
<p>Currently the dataportal prefers to display IPTC "Object Name" rather than CDM.Media.title.</p>
<p>The required preference should be: </p>
<ul>
<li>CDM.Media.title(localized)</li>
<li>CDM.Media.titleCache(if protected)</li>
<li>IPTC title (object name or caption)</li>
<li>Fallback: CDM.Media.titleCache</li>
</ul>
<p>This should be the case for all places (media page, image gallery, ...)</p>
bug #6609 (New): Google Map layers are not workinghttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/66092017-05-02T07:20:54ZAndreas Kohlbecker
<p>there is a bug in openlayers 2.13 which is fixed in openlayers 2.14-dev, this version used in the examples <a href="http://dev.openlayers.org/examples/google.html">http://dev.openlayers.org/examples/google.html</a></p>
bug #6608 (Closed): Setting the 'Bounding box' for the OSM layer no longer workshttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/66082017-05-02T07:19:27ZAndreas Kohlbeckertask #6286 (Resolved): Import Flora Hellenicahttps://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/62862016-12-18T23:02:04ZAndreas Müller
<p>Import </p>
<ul>
<li>accepted taxa with distribution and some statuses</li>
<li>synonym list including misapplications as "auct. xxx, non species author"</li>
<li>references</li>
<li>images</li>
</ul>
<p>Open issues:</p>
<ul>
<li>correct handling of subspecies in tree</li>
<li>excluded notes also to TaxonNode.excludedNote</li>
<li>basionym guessing</li>
<li>references (see above)</li>
<li><del>images</del>
<ul>
<li><del>description (metadata + file)</del></li>
<li><del>date created</del></li>
<li><del>handling "artist"</del></li>
</ul></li>
<li>image caption
<ul>
<li><del>correct startpage for detail</del></li>
<li>decide on correct feature</li>
</ul></li>
<li>maps
<ul>
<li>area captions not always shown, depending on zoom level</li>
<li>google maps not yet functional <a class="issue tracker-4 status-1 priority-10 priority-lowest" title="bug: Google Map layers are not working (New)" href="https://dev.e-taxonomy.eu/redmine/issues/6609">#6609</a></li>
</ul></li>
<li><del>chorology</del></li>
<li>synonyms
<ul>
<li>misapplications (synonyms)</li>
<li>homonyms , non (synonyms)</li>
<li><del>nom status</del></li>
<li>problems in synonym names</li>
</ul></li>
<li>deduplication (author, name)</li>
<li><del>feature tree</del></li>
<li>4 non matching images</li>
<li>change name of datasource in CDM Server and DB</li>
</ul>
<p>Open questions:</p>
<ul>
<li>chorology as state or distribution</li>
<li>sec reference (second secundum reference)</li>
</ul>