bug #7786
openERS: Try to solve those occurrence sources for which the reference number can not be resolved
90%
Description
Some of them only have a trailing whitespace problem and can be found by
SELECT * FROM emOccurrenceSource WHERE SourceNumber like '% %'
remove whitespaces
====
for others the sourceNumber can not be found in Referenc.IdInSource
bei den OccurrenceSources sind ein paar kaputt gegangen, vermutlich weil die Identifier hier nicht als Zahlen sondern als Text gespeichert werden, aus welchem Grund auch immer. Ich versuche das gerade zu säubern. Gehe ich daher Recht in der Annahme, dass • Die 2. Quelle von Polygonum propinquum Ledeb. In Rf(E) „ Tzvelev, N. N. - Konspekt flory Vostochnoi Evropy 1 2012.“ ist, genauso wie für Rf(C), Rf(S) und Uk(K) ? • Entsprechend von Persicaria lapathifolia subsp. brittingeri (Opiz) Soják für Rf(C) / SourceNumber = 22016 Außerdem: Welches ist die Quelle von • Bromus scoparius L. in Ge – SourceNumber 132003 nicht gefunden • Fallopia dumetorum (L.) Holub in Rf(C) - SourceNumber = 12231 nicht gefunden, 122311, 122312, 122315 für andere Common Names vorhanden • Von Solanum sinaicum in Ir -> SourceNumber = 13042 . Vielleicht Danin, A. - Wild plants of Eretz Israel and their distribution 1998. ? / 130421, gibt aber auch andere 13042x • Turnera ulmifolia L. , alle Areas außer Ca(T), Ca(F); / SourceNumber = 71575 • Evtl. selbe Source für Consolida ajacis (L.) Schur für Ca(P) , Ca(H) / SourceNumber= 71575 • Rumex conglomeratus Murray für It (2x) / SourceNumber = 0087 und = 7 • Ceratochloa cathartica (Vahl) Herter für Cr / SourceNumber = 130017 • Vitis rupestris Scheele und Vitis labrusca L. für Hu / SourceNumber = 5 • Juncus tingitanus Maire & Weiller für Ma / SourceNumber = 28024 • Reynoutria japonica Houtt. für Lt / SourceNumber = 12206 , evtl. Tzvelev, N. N. - Flora of Russia. The European part and bordering regions 9 2006. ?? / 122016 Nicht notwendig vermutlich • Ammannia pubiflora (Koehne) Sosn. In EM / SourceNumber = 130432
SELECT n.FullNameCache, ar.EMCode, n.NameCache, oc.PTRefFk, ocs.Source, ocs.SourceNumber, ocs.OccurrenceSourceId, oc.OccurrenceId, oc.PTNameFk, oc.PTRefFk AS Expr1, oc.AreaFk, oc.StatusUnknown,
oc.Native, oc.Introduced, oc.Cultivated, oc.WorldDistCompl, oc.SummaryStatus, oc.CalculatedFlag, oc.PTDesignationRefDetailFk, oc.PTDesignationRefFk, oc.Preferred, oc.UnresolvedPOSS, oc.As_Taxon,
oc.Sources, oc.Created_When, oc.Created_Who, oc.Updated_When, oc.Updated_Who, oc.Notes, oc.Occurrence, oc.NativeStatus, oc.IntroducedStatus, oc.CultivatedStatus, oc._oldOccId
FROM emOccurrence AS oc INNER JOIN
emOccurrenceSource AS ocs ON ocs.OccurrenceFk = oc.OccurrenceId INNER JOIN
Name AS n ON n.NameId = oc.PTNameFk LEFT OUTER JOIN
emArea AS ar ON ar.AreaId = oc.AreaFk
WHERE (ocs.SourceNumber LIKE '57610') OR
(oc.PTNameFk IN (0))
ORDER BY ocs.SourceNumber
Dann gibt es noch:
Juncus acutiflorus Hoffm. Juncus acutus L. Juncus anceps Laharpe Juncus articulatus L. Juncus bufonius L. Juncus bulbosus L. Juncus compressus Jacq. Juncus foliosus Desf. Juncus gerardi Loisel. Juncus heterophyllus Dufour Juncus conglomeratus L. Juncus effusus L. Juncus maritimus Lam. Juncus pygmaeus Thuill. Juncus squarrosus L. Juncus striatus E. Mey. Juncus subulatus Forssk. Juncus tenageia L. f. Juncus tingitanus Maire & Weiller Alle für Area Ma / SourceNumber = 57610 Und: FullNameCache EMCode Arum creticum Boiss. & Heldr. Cr Arum elongatum Steven Tu(A) Arum elongatum Steven Bu Arum cyrenaicum Hruby Li Arum balansanum R. R. Mill Tu(A) Arum dioscoridis Sm. Tu(A) Arum dioscoridis Sm. Cy Arum creticum Boiss. & Heldr. AE(G) Arum cyrenaicum Hruby Cr Arum dioscoridis Sm. AE(G) Arum creticum Boiss. & Heldr. Tu(A) Arum apulum (Carano) P. C. Boyce It Arum concinnatum Schott Gr Arum concinnatum Schott AE(G) Arum concinnatum Schott Cr Arum elongatum Steven Gr Arum dioscoridis Sm. Ir Arum besserianum Schott Uk(U) Arum concinnatum Schott Tu(A) Arum dioscoridis Sm. Le Arum dioscoridis Sm. Sy Alle für SourceNumber = 71748
Diese IdInSource gibt es. => Zu SourceNumber2Ref hinzugefügt => Testen obs jetzt tut
Sources mit leerer SourceNumber: 76
SELECT n.FullNameCache, ar.EMCode, n.NameCache, oc.PTRefFk, ocs.Source, ocs.SourceNumber, ocs.OccurrenceSourceId, oc.OccurrenceId, oc.PTNameFk, oc.PTRefFk AS Expr1, oc.AreaFk, oc.StatusUnknown,
oc.Native, oc.Introduced, oc.Cultivated, oc.WorldDistCompl, oc.SummaryStatus, oc.CalculatedFlag, oc.PTDesignationRefDetailFk, oc.PTDesignationRefFk, oc.Preferred, oc.UnresolvedPOSS, oc.As_Taxon,
oc.Sources, oc.Created_When, oc.Created_Who, oc.Updated_When, oc.Updated_Who, oc.Notes, oc.Occurrence, oc.NativeStatus, oc.IntroducedStatus, oc.CultivatedStatus, oc._oldOccId
FROM emOccurrence AS oc INNER JOIN
emOccurrenceSource AS ocs ON ocs.OccurrenceFk = oc.OccurrenceId INNER JOIN
Name AS n ON n.NameId = oc.PTNameFk LEFT OUTER JOIN
emArea AS ar ON ar.AreaId = oc.AreaFk
WHERE (ocs.SourceNumber LIKE '') AND occurrenceFk IN ( SELECT occurrenceId FROM v_cdm_exp_occurrenceAll )
ORDER BY PTRefFk, FullNameCache, ocs.SourceNumber
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
- Description updated (diff)
- Status changed from New to In Progress
- Priority changed from Priority14 to Highest
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
irgendwas ist auch noch seltsam bei folgenden Taxa:
Juncus acutiflorus Hoffm.
Juncus acutus L.
Juncus anceps Laharpe
Juncus articulatus L.
Juncus bufonius L.
Juncus bulbosus L.
Juncus compressus Jacq.
Juncus foliosus Desf.
Juncus gerardi Loisel.
Juncus heterophyllus Dufour
Juncus conglomeratus L.
Juncus effusus L.
Juncus maritimus Lam.
Juncus pygmaeus Thuill.
Juncus squarrosus L.
Juncus striatus E. Mey.
Juncus subulatus Forssk.
Juncus tenageia L. f.
Juncus tingitanus Maire & Weiller
Und zwar bei der 7500000 Version.
- Problem: Am Area Ma hängt eine SourceNumber 57610 . Die finde ich so nicht bei den Referenzen. Als Source Cache (der nicht unbedingt stimmen muss) finde ich aber in der Tabelle folgende Einträge:
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Personal Communication (J. Molero) (2003)
Standardliste der Farn- und Blütenpflanzen Deutschlands (1998)
Nouvelle Flore de L'Algerie et des Regions Desertiques Meridionales 1 (1962)
Catalogue des Plantes vasculaires de la Corse (1985)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Flore de la Tunisie (1979)
Nouvelle Flore de L'Algerie et des Regions Desertiques Meridionales 1 (1962)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Flora Iberica. Plantas vasculares de la Península Ibérica e Islas Baleares. 8 (1997)
Catalogue des plantes du Maroc 4 (1941)
Svensk Flora: Fanerogamer och ormbunksvaxter 27 ed. 27 (1994)
Compléments au prodrome de la Flore Corse (1993)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Catalogue des plantes du Maroc 1 (1931)
Flore du Sahara (1977)
Kannst du das nochmal gegenchecken.
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
bei den OccurrenceSources sind ein paar kaputt gegangen, vermutlich weil die Identifier hier nicht als Zahlen sondern als Text gespeichert werden, aus welchem Grund auch immer.
Ich versuche das gerade zu säubern. Gehe ich daher Recht in der Annahme, dass
• Die 2. Quelle von Polygonum propinquum Ledeb. In Rf(E) „ Tzvelev, N. N. - Konspekt flory Vostochnoi Evropy 1 2012.“ ist, genauso wie für Rf(C), Rf(S) und Uk(K) ?
• Entsprechend von Persicaria lapathifolia subsp. brittingeri (Opiz) Soják für Rf(C) / SourceNumber = 22016
Außerdem: Welches ist die Quelle von
• Bromus scoparius L. in Ge – SourceNumber 132003 nicht gefunden
• Fallopia dumetorum (L.) Holub in Rf(C) - SourceNumber = 12231 nicht gefunden, 122311, 122312, 122315 für andere Common Names vorhanden
• Von Solanum sinaicum in Ir -> SourceNumber = 13042 . Vielleicht Danin, A. - Wild plants of Eretz Israel and their distribution 1998. ? / 130421, gibt aber auch andere 13042x
• Turnera ulmifolia L. , alle Areas außer Ca(T), Ca(F); / SourceNumber = 71575
• Evtl. selbe Source für Consolida ajacis (L.) Schur für Ca(P) , Ca(H) / SourceNumber= 71575
• Rumex conglomeratus Murray für It (2x) / SourceNumber = 0087 und = 7
• Ceratochloa cathartica (Vahl) Herter für Cr / SourceNumber = 130017
• Vitis rupestris Scheele und Vitis labrusca L. für Hu / SourceNumber = 5
• Juncus tingitanus Maire & Weiller für Ma / SourceNumber = 28024
• Reynoutria japonica Houtt. für Lt / SourceNumber = 12206 , evtl. Tzvelev, N. N. - Flora of Russia. The European part and bordering regions 9 2006. ?? / 122016
Nicht notwendig vermutlich
• Ammannia pubiflora (Koehne) Sosn. In EM / SourceNumber = 130432
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
SELECT DISTINCT SourceNumber2Ref.*, r.*
FROM SourceNumber2Ref INNER JOIN
Reference r ON SourceNumber2Ref.RefId = r.RefId
WHERE SourceNumber2Ref.RefId = '6432864' OR IdInSource like '%22316%' OR IDInSource like '%26524%' OR r.RefId = 22316
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
- Subject changed from Try to solve those occurrence sources for which the reference number can not be resolved to ERS: Try to solve those occurrence sources for which the reference number can not be resolved
Updated by Andreas Müller over 4 years ago
- Priority changed from Highest to Priority13
Updated by Andreas Müller almost 4 years ago
- % Done changed from 40 to 80
most of them seem to be errors, especially those having no number at all. Others can not be resolved.
Updated by Andreas Müller almost 4 years ago
- Status changed from In Progress to Resolved
- % Done changed from 80 to 90
ERS:
dies sind vermutlich alles Tippfehler. Doppelte Leerzeichen zwischen den Referenznummern in den Greuter-Tables haben zu so komischen Referenzen geführt. Wenn die nicht importiert werden können , ist alles gut. Siehe screenshot unten, wo steht: "Source():" Eine echte Quelle steht in diesen Fällen nicht dahinter.
AM:
leider sind hier von den ursprünglich 77 Fällen noch 61 übrig geblieben. Sieht so aus als ob nur die Fälle von 7000000-7200000 behandelt wurden und wenige andere.
Im Anhang findest du die noch übrigen Fälle. Kannst du da nochmal drauf schauen. Super schlimm ist wäre es vermutlich nicht, wenn die nicht behandelt werden, da fehlende SourceNumbers können dann sowieso nicht importiert werden. Wenn es sich also nur um versehentliche Einträge handelt, wäre es nicht schlimm. Falls es sich aber um Einträge handelt, die eigentlich einer wirklichen Quelle zugeordnet sind, die sich recherchieren lässt, wäre es schade um die Daten.