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feature request #7700

closed

use TypeDesignationSetManager for creating typedesignation string in cdmlightExport

Added by Katja Luther over 4 years ago. Updated over 1 year ago.

Status:
Closed
Priority:
Highest
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Category:
cdmadapter
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100%

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Severity:
normal

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Blocked by EDIT - task #7553: move TypeDesignationSetManagerIT to cdmlibClosedKatja Luther

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Updated by Katja Luther over 4 years ago

see also #7695

the typedesignationSetManager already do the deduplication of specimen for one homotypical group and creates a taggedText, we should use this in cdmlightExport.

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Updated by Andreas Müller over 4 years ago

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Updated by Andreas Müller over 4 years ago

  • Related to feature request #7695: web service providing compact TypeDesignation representation for homotypic groups and individual taxa added
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Updated by Andreas Müller over 4 years ago

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Updated by Andreas Kohlbecker over 4 years ago

  • Blocked by task #7553: move TypeDesignationSetManagerIT to cdmlib added
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Updated by Katja Luther over 4 years ago

  • Status changed from New to Resolved
  • Assignee changed from Katja Luther to Andreas Müller
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Updated by Katja Luther over 4 years ago

the mail from WB:

Hallo,
habe mir das angesehen. Es gibt ja praktisch 3 Fälle.

  1. Gesamte information ist im Cache.

Bei fehlender Referenz ist der output hier ok:

Jumaat H. Adam, JHA 8000, Malaysia, Selangor, Campus Universiti Kebangsaan Malaysia. 2nd August 2001. Holotype (UKMB), Isotype (UKMB).

Der Punkt an Ende stammt allerdings aus dem Cache, der sollte, wenn fehlend, gesetzt werden, oder, wenn fide folgt, entfernt und am Ende gesetzt werden. Das Setzen am Ende kann ich natürlich machen, das Entfernen notfalls auch (replace „. [„ w „ [„ allerdings könnte das eventuell mit anderen Texten kollidieren, da ich das wohl zunächst global machen würde.

Bei vorhandener Referenz:

Indonesia, Borneo, East Kalimantan, Berau Regency, Mount Nyapa (formaerly Njapa), along the Kelai River, 1000 m altitude, 25. 10. 1963, Kostermans 21495 (holotype, L) & Kostermans 21495 Sheets I & II (isotypes; K)[fide Robinson, Nerz & al. (2011)]

Hier fehlt das Leerzeichen zwischen Cache und fide Zitat, und der Punkt am Ende.

  1. Gesamte Information ist atomisiert.

a) Nur ein Beleg:

Holotype: van Leeuwen 19834 (BO).[fide Robinson, Nerz & al. (2011)]

Alles gut, bis auf Punktsetzung und Leerzeichen. Zur Voranstellung der Type Category s.u.

Mit Angabe einer Akzessionsnummer:

Holotype: Philippines, Dinagat Island, M. Micheler & A. Wistuba s.n. (CMUH 00008636).

Auch gut (ich habe die Nennung des Herbars in der Akz.Nr. entfernt).

Mit weiteren Angaben (Geo):

Philippines, Mindanao Island, Davao Oriental Province, Mt. Hamiguitan, alt. 1300 – 1600 m, V. Amoroso & R. Aspiras CMUH 00003545 (CMUH).

Gut! Auch die Punktsetzung.

b) Mehrere Belege:

Bei zwei verschiedenen Aufsammlungen:

Unknown type category: Philippines, Mauban, Nöe s.n. (P).Unknown type category: Madagascar, Commerson s.n. (P).

OK bis auf fehlendes Leerzeichen zwischen den Belegen.

Holotype: Borneo, Sarawak, Mt Mulu, western ridge, alt. 1900 – 2400 m, 18.3.1964, Hotta 14791a. (KYO).Isotype: Borneo, Sarawak, Mt Mulu, western ridge, alt. 1900 – 2400 m, 18.3.1964, Hotta 14791a. (L).

Im Prinzip korrekt, aber nicht dedupliziert. Bei der Deduplizierung funktioniert das mit dem Voranstellen der Kategorie dann auch nicht mehr. Zielvorstellung ist folgendes:
Borneo, Sarawak, Mt Mulu, western ridge, alt. 1900 – 2400 m, 18.3.1964, Hotta 14791a. (Holotype: KYO, Isotype(s): L).

Hier kommt dann noch die Komplikation hinzu, dass die Referenzierung verschieden sein kann – ist sie gleich wäre das etwa so:

(Holotype: KYO; Isotype(s): L [fide xxxy 1999]).

Sind sie aber verschieden, wird’s komplizierter:

(Holotype: KYO, Isotype(s): L [fide xxxy 1999]; B [fide abdc 2001]).

  1. Mischung zwischen atomisiert und Cache

Ich glaube, dann übernimmt der Cache? Das ist eventuell problematisch, da ich (glaube ich) in einigen Fällen das Land herausgenommen und atomisiert abgelegt habe, damit der Beleg auch in der Tabelle auftaucht – dieses dann aber aus dem Cache gelöscht habe. Kann man wohl aber nicht auf die Schnelle lösen.

Herzlichen Gruß
Walter

Actions #8

Updated by Katja Luther over 4 years ago

Actions #9

Updated by Katja Luther over 4 years ago

Actions #10

Updated by Katja Luther over 4 years ago

Actions #11

Updated by Andreas Müller over 2 years ago

  • Tags set to cdmlight
Actions #12

Updated by Andreas Müller over 2 years ago

  • Related to feature request #9262: Several open issues for cdmlight export related to Cactaceae and other Caryophallales added
Actions #13

Updated by Andreas Müller about 2 years ago

  • Related to feature request #9279: Improve type designation formatting and TypeDesignationSetManager added
Actions #14

Updated by Andreas Müller about 2 years ago

  • Status changed from Resolved to Closed
  • Assignee changed from Andreas Müller to Katja Luther

I think we can close this ticket as there is kind of a follow up ticket with #9279

Actions #15

Updated by Andreas Müller about 2 years ago

  • % Done changed from 0 to 100
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Updated by Andreas Kohlbecker over 1 year ago

  • Tags changed from cdmlight to cdmlight, type designation
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