merge-update from trunk

eu.etaxonomy.taxeditor.product, eu.etaxonomy.taxeditor.feature/feature.xml, eu.etaxonomy.taxeditor.feature.platform/feature.xml : commented out license text to prevent extra popup on update
plugin(_de,_en).properties : added license info to productBlurb used in the About popup
ApplicationWorkbenchWindowAdvisor, IPreferenceKeys, TaxonomicEditorGeneralPreferences : removed preference for allowing update checks on startup as this is already provided by rcp
ApplicationWorkbenchWindowAdvisor, ApplicationUtil, P2Util, UpdateHandler : changed setting of default repositories to make sure that they are set on startup

setting unsigned policy to always allow unsigned jars to be updated

 - added support for image gallery creation for FieldUnits (#4389)
 - added support for DerivateView to MediaView

#4389
 - unified "New Image Gallery" command and handler for TaxonEditor and BulkEditor
 - Removed "Add Derived/Field Unit Media" command
 - added interface IPartContentHasMedia to specify that the MediaView should react to selection changes of implementers

Added copy button to popup and context info to the error trace

 - removed unused variable

 - avoid possible NPE

adding options to ensure that the product .zip files are not signed

adding signing of jars to maven package phase
P2Util : added snapshot dir to list of hardocded sites
eu.etaxonomy.taxeditor/pom.xml : added signJars and uploadRepo (from parent pom) profiles
pom.xml : removed uploadRepo (from parent pom) profile
feature.xml : removed update configurator plugin as it clashes with simple configurator

 - externalized plugin.xml

 - fixed possible LazyInitializaitionException in DerivateLabelProvdider

added CET to end of build date

set org.eclipse.update.reconcile to false to avoid logging of bundle already being installed errors

added caused by to multistatus error dialog

OpenDefinedTermEditorHandler : changed error dialog to warning since there is no exception
CdmErrorDialog : changed copy item text to avoid confusion
MessagingUtils : cleanup and added MultiStatus errorDialog to solve windows problem (#4416)

 - removed @Cascade for country in GatheringEvent because DefinedTerms should not be cascaded
 - added new service method to occurence service to find all CDM entities that are not saved via cascading
 - added tests for new method
 - added test for concurrent session saving of terms
 - made use of method for specimen import via DataImportView

added comments

added check for entity being null

added profile for uploading plugins to update site

eu.etaxonomy.taxeditor.product : updated start levels, added update specific arguments
feature.xml x 2 : added dependencies for p2 updates
IPreferenceKeys : added the key to allow updates at startup
TaxonomicEditorGeneralPreferences : added checkbox to allow updates at startup

mappings file for about properties

P2 update implementation and editor version extraction

ApplicationWorkbenchAdvisor : clean up
ApplicationWorkbenchWindowAdvisor : added update of editor to startup
P2Util : replaced older class with a new one which handles background update of editor
UpdateHandler : handles modal update of editor when requested
InstallNewSoftwareHandler, PreloadingRepositoryHandler : handlers for installing new software and preloading repositories (not used yet)
ApplicationUtil : added new methods to retrieve editor version number
TaxonomicEditorPlugin : added new methods for retrieving provisioning elements
build.properties, pom.xml, plugin_en.properties, plugin.properties, plugin_de.properties : setup dynamic properties (version number , build date) to be replaced via maven
plugin.xml, MANIFEST.MF : added new dependencies for p2 update mechanism
p2.inf : deleted since we now setup update repositories programmatically

added new error dialog for operations

 - bind conversation before saving specimen

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 - implemented unstable DataImportView which will replace DataImportEditor

 - added label to EmptyElement
 - added EmptyElement to NonViralNameDetailSection if taxon.getName() is null (fixes #4221)

change labels for relationship descriptions #4087

 - moved toggle button to the top-right corner of the Media(Specimen)Section (#3339)
 - Changed label

Updated version in config files to 3.3.8-SNAPSHOT

Updated version in config files to 3.3.7

 - added full square as replacement for control characterers (#2248)
 - added flag to TextWithLabelElement to allow multi-line behavior
 - changed description labels (#4087)
 - renamed method

Renamed label "Messages" to "Error Log"

 - added filter button to setEnabled()

 - fixed possible ClassCastException

 - fixed typo

 - implemented functionality to reuse media in MediaView (#2385)

 - fixed removing of control characters (fixes #4373, affects #2248)
   - added condition to only replace if the string contains control characters
   - cursor will still jump back but only when control characters were removed
 - removed unused method

 - added javadoc

 - renamed interal_selectionChanged() to selectionChanged_internal()

 - moved parsing message section to top of details view (fixes #1659)

 - added property tester for context menu entries for media view (#3339)

 - remove control characters from TextFields (fixes #2248)

 - added forceDirty() method to set the BulkEditor dirty when editing in MediaView #2407
 - TODO: should be replaced with the possibility to set views dirty when we move to Eclipse 4

 - used native SWT checkBox button to toggle advanced view

 - separated user interface to add media into two classe (#3339)
 - added it to MediaSpecimenGeneralDetailElement

Added note to default language preference page to inform the user about restarting the editor after making changes to the language setting.

refactored default language selection methods.

Indirect dependency from bioinfweb.commons added.

Initial height distribution implemented in AlignmentEditor.

 - generalized simple user interface to add media (#3339)

remove logging for DerivedUnitFacadeNotSupportedException as it is handled #3846

Handle null object in StoreUtil.getCdmEntity

 - added toggle button to simple media user interface (#3339)

 - added finally-clause for asynchronous delay flag
 #2754

Added Default Language Selection for the TaxonomicEditor to fix #4358

DeleteResult handling in DeleteSynonymOperation

First pherogram displaying example added to the alignment editor. (Path to test resource need to be adjusted.)

eclipse preference changes

 - adapted to changes in messaging framework

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 - implemented asynchronous selection changed event for subclasses of AbstractCdmEditorViewPart
   - all sub classes must implement internal_selectionChanged() method where the usual selection handling is done
   - the super class invokes internal_selectionChanged() asynchronously
   - this should fix the arbitrary warning of recursive part activation
   - it also prevents double activation which occurred in the DetailsView from time to time

fix for #2754

 - fixed possible NPE

 - added missing @Override
 - fixed use of static method

 - fixed possible IllegalStateException (#4351)

 - added null check (fixes #4351)

 - fixed persistent saving of media of a MediaSpecimen (#3339)

 - implemented setFocus() of all EditorParts
   - this is to avoid "java.lang.Exception: java.lang.RuntimeException: WARNING: Prevented recursive attempt to activate part"
   - either set the focus to shell or set it to the viewer used

fix for #2754

 - adapted to interface changes in cdmlib

 - added simple user interface to add media (#3339)

 - fixed adding of child to parent ICdmFormElement in else clause

MessagingUtils : added option for displaying contact message in the error dialog
ApplicationWorkbenchAdvisor : using new method with contact message
AbstractBulkEditorInput : added errorDialog for MergeException

ApplicationWorkbenchAdvisor : added comments
EditPasswordElement : Added to make sure user exists in db before changing password
UserDetailElement : Disabled user text field since User is immutable
NewObjectHandler : added non-empty validator for the case of User and Group

New class for logging and dialog functionality

Moved all logging and dialog functionality to the new class MessagingUtils.
Refactoring code to adapt to above change.
Added new custom error dialog - CdmErrorDialog
Added runtime exception handling to the ApplicationWorkbenchAdvisor by adding a custom status handler

reintegrated redlist branch into trunk

Example object demonstrating pherogram and alignment data to be stored in CDM added.

BulkEditorQuery udpate

update ReferenceDetailElement

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adapt to new return type for name authors

added possibility to show / hide uuid column
added scrolling to the viewer

adapt TransientNameService

Commenting out single click opening of name editor (ticket 4300)

MemberDetailElement : removed member label string
EntitySelectionElement : removed " : " suffix to label string when label string is empty

corrected behaviour when adding / saving new authorites

Text encoding changed to UTF-8.

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 - fixed bug that showed double or no '&' (#4302)

Test version of an AlignmentArea added to AlignmentEditor.
Dependencies of LibrAlign added in provisional form.
  During initial development stage you need to check out the following two additional project into your workspace:
  - bioinfweb.commons as "_Lib" from https://secure.bioinfweb.info/Code/svn/commons.java/trunk/main/
  - LibrAlign as "LibrAlign" from https://secure.nefertem.bioinfweb.info/private/svn/LibrAlign/trunk/main/
  (These dependencies will be replaced by JARs after the initial development phase of this branch.)

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LockMode issues in transient services

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 - added empty AlignmentEditor

creating taxeditor branch for LibrAlign integration