Merge branch 'develop' into LibrAlign

fix git commit

minor

minor

the version of h2 info was duplicated

fix test

fix test

set the failing test to ignore, I will fix it tomorrow

revert the last commit of this file

Fix session disposal #5694

fix #5816

fix for #5638

add symbol to DefinedTerm details view

fixing the deletion of polytomous keys

add PolytomousKeyService to CdmStore.getService and EditFromSelectionWizard

More i18n for #5758

Typo

i18n for #5758

Remove "Close Connection" and changed "Connect" to "Create Data Model"
#5758

Adapt CdmServerInfo to always include cybertaxonomy.org (production) #5769

Preliminary adapt CDM model cacher script to work for cached model update

Add support for PersistentBag #5781

Merge branch 'develop' into LibrAlign

Merge branch 'release/4.0.0' into develop

Updated version in pom / project files to taxeditor version : 4.1.0-SNAPSHOT and cdmlib version : 4.1.0-SNAPSHOT

Updated version in pom / project files to taxeditor version : 4.0.0 and cdmlib version : 4.0.0

Classpath in molecular.lib updated.

Test case for SequenceIDIterator added.

Context menu entry for exporting alignment files added.
ExportSingleReadAlignmentHandler renamed to ExportSequenceToFileHandler.

Exported packages of molecular plugin updated.
Basic export functionality for direct export of consensus sequence alignments implemented (untested).

Exports of plugin molecular.lib updated.
Minor changes.

Update cached CDM

Update Editor tests to 4.0

Update Editor tests to 4.0

Update TaxEditor H2 test database to 4.0

Cleanup transient agent service

Remove sourced object form referencing objects view  #5743, #5746

Merge trunk into branch

Fix dependencies and model update

Move command added to POM of molecular.lib plugin.
Minor changes.

Fix enabling/disabling of referencing obejcts table #5603

Fix dependencies and model update

i18n for derivate view context menu #5406

Add suppport for User and Group to ReferencingObjectsView #5603
 - disable viewer table when no selection available

JPhyloIO dependencies added to molecular.lib.

Typo correction.

fix test

smaller changes for drag & dop with natural order in taxonnavigator

fix #5524

minor

fix for #5710 reset the terms when changing the datasource in remoting

add a comment

short hotfix for wrong dirty flag after change synonym to misapplication

improve the delete configurator dialogs for taxa and synonyms

minor

Initial version of ExportSingleReadAlignmentWizardPage added.

fix #5689

Fix potential NPE

centralizing dependency versions and managing libraries in lib/ through maven

#5705 fixing library dependencies for local managed cdm-server

fix not deleted caches if a new datasource is set

Enhance source comparator #3185

Implement generic comparator for OriginalSourceBase #3185

Create taxon/parse name when wizard is closed and not with every key
stroke #5605

Correctly handle UuidAndTitleCache type in SearchResultView #5700

remove one of the menu items for media bulk editor

Merge branch 'LibrAlign' into develop

Merge branch 'develop' into LibrAlign

Double click on taxon search opens Name Editor #5689

Fix section title for specimen determinations #5673

Add "Open in..." menu to polytomous key editors and navigator #5610

Correctly update referencing objects view for null selection and for
defined terms #5603

Correctly handle UuidAndTitleCache objects in "Open in..." menu

fix #5669

Merge branch 'develop' into LibrAlign

merge develop into branch

add missing transient service

Add "Open in..." to taxon search #5616

Add "Open in..." to referencing objects view
 - fix potential NPE

Fix potential overlap of handlers for opening derivative editor

Add space between label and textfield for all wizards #5436

Set selection to newly created field unit #5406

Switch menu entries #5406

Fix label for taxon description #5547

Correctly implement compare contract #3185

Fix potential Widget is disposed exception

Info message when trying to open non-persisted IndividualsAssociations

Use entity as parameter instead of uuid to avoid conflicts with
transient objects

comment the failing line out because the remove null value call in getChilren method converts the persistent list into a arraylist

don't allow delete a taxon used in a classification

minor changes

move restore navigator status to taxonNavigator preferences

move Disable services api timestamp check to debug preferences

minor changes for #4657

fix #4657

show error message for widget is disposed dialog

fix 5641

Fix spacing for detail view elements #5436

fix #5641

Fix potential NPE #5513