merge-update from trunk

Update transient services with new delete method

merge-update from trunk

Show abbreviated title cache for authors and refernce in taxon details
view

Show URI parsing exceptions below URI text field (fixes #5055, #5003, #4587)

Avoid duplication of edited team member (#4997)

Add no marker without a markerType (#4588)

Add ticket number to TODO

Refresh view after media view has been switched

Add MediaViewSwitch to media collection elements

Refactored code to use a static method that creates the IAction object.
This can be added by the GUI element itself.

Add button for advanced media view to media attached to desccriptions

Remove duplicate code for advanced media view (#4862)

Refactored code and added interface and abstract class to avoid
duplicate code.

Remove comments

Remove comments

Fix typo

#5036 Add missing command for polytomous key delete

Adjustments to recent changes in TIC. (EDITor Code from now on written against unreleased TIC 2.x.)

Fix remoting code compilation errors

Merge branch 'develop' of ssh://dev.e-taxonomy.eu/var/git/taxeditor into develop

Empty text fields return empty string and not null

Revert "index on develop: 6992bef Rename NonViralName authorteams to authorship #4968"

This reverts commit 32cded397931ad359f7818fdfb91a113a074342e.

Rename NonViralName authorteams to authorship #4968

Update cdmlib version to 3.6.3-SNAPSHOT

Some actions for adjusting pherogram displaying added.

Delete renamed file

PherogramViewPart  that is started from within AlignmentEditor now uses a shared pherogram model to display cut positions.

Fix issues with merge conflicts

Fixes from Katja for commit issue

Position properties of LibrAlign pherogram models are now connected to according CDM node properties (yet untested).

Fix problem with non persisted taxon titleCache change: #5018

adapt service call to model change

adapt transient service methods to cdmlib changes

 - update parent scroll form on property change (fixes #4881)

 - removed initial expand of sections

 - fixed potential NPE

 - fixed potential NPE

 - changed type of "Materials & Methods" to text instead of DefinedTerm
 - fixed label

 - split off "Preparation/Preservation section" from dna sample general
section

Adjustments to recent changes in LibrAlign.

fixed conflicts from last commit

all delete methods need an Uuid as argument

Conflicts:
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientAgentService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientDescriptionService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientNameService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientOccurenceService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientReferenceService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientTaxonService.java
eu.etaxonomy.taxeditor.editor/src/main/java/eu/etaxonomy/taxeditor/editor/view/dataimport/transientServices/TransientTermService.java

change delete argument to UUID

add empty test folder

Actions for creating and updating the consensus sequence in AlignmentEditor implemented.

AbstractAlignmentEditorHandler added.

Merge remote-tracking branch 'origin/develop' into develop

minor

merge-update from trunk

ToggleInsertOverwriteHandler now also triggers enabling and disabling of ToggleLeftRightInsertionHandler when the insert key is used instead of the tool bar button.
Actions for cutting pherograms on the left and right ends added.
Action for reverse complementing single reads added.
Minor changes.

Merge branch 'develop' of ssh://dev.e-taxonomy.eu/var/git/taxeditor into develop

fixing for compatibility with merged cdmlib

 - added transient service methods

add empty folder

 - fixed order of team members #4936

 - fixed NPE (#4937)

 - removed inBetween target for Derivative Editor (fixes #4966)

Icons added for insert/overwrite button in AlignmentEditor tool bar.
Insert left/right in pherogram disabled when switching to overwrite mode.

 - removed test folder

Merge branch 'develop' of https://dev.e-taxonomy.eu/git/taxeditor into develop

 - removed test folder from classpatch

Adjustments to recent changes in LibrAlign.

fix umlaute in key menus and add gitignore for rcp.target

Further adjustments to recent changes in LibrAlign.

Adjustments to recent changes in LibrAlign.

merge-update from trunk

merge-update from trunk

fixed manifest versions

new .gitignore file

removed test source from classpath

fixed update to snapshot

corrected cdmlib version to snapshot

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

Updating develop poms to hotfix version to avoid merge conflicts

Merge branch 'hotfix/3.6.1'

updating poms for branch'hotfix/3.6.1' with non-snapshot versions

version updates for 3.6.1

updating poms for branch '3.6.1' with snapshot versions

fixing classpath config

fixing classpath config

Release 3.6.0 merge

merged jgitfow plugin

merged for gitflow plugin

added jgitflow plugin

 - updating versions due to release

updated to snapshot version

Merge branch 'master' of wp5.e-taxonomy.eu:/var/git/taxeditor into develop

Conflicts:
eu.etaxonomy.taxeditor.cdmlib/.classpath

Updated version in config files to 3.6.1-SNAPSHOT

Merge branch 'move-to-luna' of wp5.e-taxonomy.eu:/var/git/taxeditor into develop

Conflicts:
eu.etaxonomy.taxeditor.cdmlib/.classpath

Updated version in config files to 3.6.0

 - added wizard page listener to react on ENTER key #4853

 - added wizard page listener to react on ENTER key #4853

 - added context menu entry for editing classifications
 - used generic extension point for cdmViewer in navigation project (#4865)

 - code conventions

 - code conventions

minor

add checkbox for additional team members

change synonym to accepted taxon message when taxon could not be deleted

delete taxonnode if taxon is used somewhere else fixed

 #4725

minor