cleanup

ref #6314: add deprecated method setSuccess

code cleaning

ref #6314: implementation in progress, exportResult adaptions

using cybertaxonomy.eu instead of wp5.e-taxonomy.eu

ref #6314: add Tropicos Name Identifier Type

ref #6314: meta data adaption

ref #6314: code cleaning for csv import/export

missed to add adapted interface

use remotingProgressMonitor for setSecundumReferenceForSubtree

ref #6158 Update documentation from svn to git

remove required from TaxonNAMEBase.cultivarName JAXB definition

remove required from TaxonBase.name JAXB definition

cleanup

ref #6133 add csv file for German ranks (still incomplete)

minor

#6241 disabling doclint in javadoc-plugin

smaller changes in DwC-A Export

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/4.6.0'

updating poms for branch'release/4.6.0' with non-snapshot versions

ref #6496 fix missing pages in bibliographic references (not yet fixed for book sections)

fixing missing paging criteria in TypeDesignation DAO

updating poms for 4.7.0-SNAPSHOT development

fix #3532 write test for "null" nom ref for databases, cdDvd and webpage, original issue was fixed already

ref #5834 tests for generic volume, still partly commented, solution not yet implemented

cleanup

fix #6111  hopefully fix MySQLSyntaxErrorException during call to CdmEntityDaoBase.list()

cleanup

fix #6363 Implement validation rules for all taxon names

ref #5620 reduce log level for Reference null titleCaches

cleanup

ref #5117 add slash to UML link

ref #6459 added IntextReferenceHelper class and added some more tests (for name and Annotation)

ref #6488 Add media title cache as FormatKey

ref #6488 Extract String constant

ref #4232 implement comparator contract for DistributionNodeByAreaLabelComparator

ref #4232  Improve OrderedTermBase.performCompareTo to include vocabulary information

fix #6449 Add convenience method to set both caches as protected

ref #6449 Avoid empty titleCaches if only one cache is protected

fix failing tests

fix failing tests

fix #6459 Implement deduplication for IntextReferences (add interface to SpecimenOrObservationBase)

fix #6459 Implement deduplication for IntextReferences

cleanup

ref #6484 Fix test for specimen count retrieval

 - temporary fix until ticket is solved

fix #6322 Speed up result count for specimen search

avoiding LIE in name catalogue controller

using jetty 9 runtime variable in launcher

ref #1606: fix exception for pattern ? in reference selection dialog

cleanup

ref #4390 adapt boolean value for protected

fix #6440 fix IPNI name service test

fix #6440 implement logging for hybrids in IPNI service

ref #6440 fix most of the IPNI name service issues

cleanup

fix #6439 Add (Heft xxx) as part of volume to name parser

fix #5554  lat/long parsing with single and double quotation mark and whitespace

ref #6365 remove BotanicalName from IPNI service

cleanup

ref #6410 latest changes for eFlora (FM 15) import

cleanup

add transient method isHybridName (cont.)

ref #6419 update remaining bean names for cdmRepository

ref #6410 handle hybridClass attribute

add transient method isHybridName

ref #6419 update bean name in CdmApplicationController

fix #6381 Also use barcode or catalogue number for titlecache if accession number not exists

provide the new IRightsService in service layer

fix excel import from editor

ref #6100 comment open issues with accent acute

ref #6100 fix Sant'Anna parsing

ref #6100 fix Man in 't Veld and De la Torre (maybe fixed already before) and add some hybrid stuff

cleanup

ref #6100 fix author issues for la Croix, ´t Hart and C.I

ref #6100 fix parser subgen. and forma

ref #6100 fix parser for bis and ter in author string

ref #6100 fix parser for jun. in author string

ref #5983 and ref #6410  parsing of hybrid formulas with missing name parts

ref #6158 Update documentation from svn to git (cdmlib-print)

 - update links from trac to redmine
 - update links to cybertaxonomy.eu

ref #6158 Update documentation fro svn to git

 - update links from trac to redmine
 - update links to cybertaxonomy.eu
 - increase maven-site-plugin version to 3.3

ref #6262: adding funtionality to library to access rights for selection dialog

ref #6406 revert MarkupTransformer temporarily to allow compilation

ref #6410 fix markup compile issues

ref #6419 some remaining CdmRepository issues

ref #6427  javadoc

ref #6410 Latest changes to Markup import

cleanup

new factory methods for sources

cleanup

ref #922 move compareTo test to subclasses

Cleanup

ref  #6262: create dao and service for rights

ref #6214: add the PreferencePredicates for the project specific preferences

ref #6419 renaming ICdmApplicationDefaultConfiguration to ICdmRepository

fix #6419 renaming CdmApplicationDefaultConfiguration to CdmRepository

ref #2495 Revert "prevent ipni tests from failing when external server is absent"

This reverts commit 9a211f95133eddfd9fe49a25bbd22ca4a5b841c5.

minor documentation improvement