cleanup

ref #10273 adapt WfoContentExportTransformer

ref #10488 add unique citation string and long citation to cdmlight

ref #10487 rename nameUseInSource to original spelling in CDM light name table

cleanup

ref #10322, ref #9524, ref #4911 fix omit level handling in computed area trees (cont.)

ref #10322, ref #9524, ref #4911 fix omit level handling in computed area trees

ref #10322, ref #9524, ref #4911 fix source loading for distribution tree

cleanup

ref #10322, ref #9524, ref #4911 add switch to allow loading the old way until new is ready

ref #10322, ref #9524, ref #4911 fix distributionInfoConfig handling in distribution service

cleanup

ref #9524 fix compile errors

ref #9524 improve non-dto object loading

rename TaggedCacheHelper ->TaggedTextFormatter (cont.)

ref #10322 move source type filter to base class (in develop)

ref #10273 add description types (cont.)

rename TaggedCacheHelper ->TaggedTextFormatter

ref #10322 move source type filter to base class

ref #10273 add description types

cleanup

ref #10322 filter sources by type (primary sources only)

ref #10273 add missing establishmentMeans column label

ref #10178 namematching Controller

ref #10273 add base classes for WFO exports

ref #10273 some first steps for the WFO content export

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN) (cont. by adding authorshipCache as criteria)

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN) (cont. by adding also taxon uuid as criteria)

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN)

cleanup

minor

Revert "ref #7771: test adaption"

This reverts commit 9264d508afc6823675e7e541b3898ac9b795d9e0.

Revert "ref #7771: use representation of taxon rel type for display"

This reverts commit 89f511ab0ea7e38a282e9ff60f5e4ec0e460d40e.

ref #7771: test adaption

ref #7771: use representation of taxon rel type for display

set the test to ignore again

ref #7771: adapt TaxonRelationshipFormatter

ref #10178 exact matches score corrected

ref #10178 list of names as input

cleanup

use StringResultDto for ws result

ref #10322 add parameterless hql-result method to genericDao

cleanup

ref #10322: add countMethod to polytomouskey controller

ref #10322 fix data loading for test

ref #10322 add first test for PortalDtoLoader

ref #10322, #10474 add OccurrenceInfoDto

ref #10322 implement withXXX in PortalDtoLoader

ref #10471 split code for better debugging of NPE

fix NPE in association check

cleanup

fix potential NPE in TaxonNodeDto

cleanup

Check dao null exception

ref #10472 fix remote findDto method

ref #10472 add taxonFindDto search

ref #461, ref #9940, ref #9941 allow preceding type status label (and set as default)

revert model changes

replace by DASH_W (cont.)

replace by DASH_W

ref #461, ref #9940, ref #9941 add precedingMainType and accessionNoType params to type designation formatter

cleanup

ref #7045 fix test/incorrect object loading introduced for readonly test

ref #7045 use real DTOs for loading childNodesOf

cleanup

used defined uuid1

remove unused property path

#7045 move createNodeDtos to result class

ref #10472: add Methods to get accTaxonUuid and nom citation

ref #10322, ref #10474 order derivates on short label

extract SpecimenOrObservationBaseComparator

update javadoc for SpecimenTypeDesignationStatus

ref #10322, ref #10474 make SpecimenOrObservationBaseDTO.derivatives ordered

cleanup

remove unused getTaxaByName method from taxonDao

some javadoc

ref #10322, ref #10474 remove not fully implemented specimen implementation from DTO for now

ref #10322, ref #10474 use timePeriod instead of gatheringStartDate in all occurrence context

ref #10322, ref #10474 fix recordBase handling (cont.)

ref #10322, ref #10474 fix recordBase handling

ref #10322, ref #10474 handle contigFile

ref #10322, ref #10474 add DnaQualityDTO

ref #10322, ref #10474 add addAmplificationResultDTO, SingleReadDTO and PrimerDTO

ref #10322, ref #10474 cleanup fieldunit and improve data handling and comparison (cont.)

ref #10322, ref #10474 cleanup fieldunit and improve data handling and comparison

cleanup

ref #10322, ref #10472 further remove model objects, use DerivationEvent and some cleanup

ref #10322, ref #10472 remove defiend terms and OccurrenceType from SpecimenOrObservationBaseDTO

ref #10322, ref #10472 remove model objects from specimenDTOs

ref #10322 clean specimenDTOs and TaggedEntityReference factory method

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor (cont. ||)

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor (cont.)

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor

cleanup

ref #10322 fix missing label for CollectionDTO

ref #10322 cleanup specimen DTOs

ref #10322 try to fix derivatives handling

Correct typo in ORCID IdentifierType description

ref #10273 add WfoContentExport classes (still dummy, copied from backbone export)

cleanup