rename TaggedCacheHelper ->TaggedTextFormatter

ref #10322 move source type filter to base class

ref #10273 add description types

cleanup

ref #10322 filter sources by type (primary sources only)

ref #10273 add missing establishmentMeans column label

ref #10178 namematching Controller

ref #10273 add base classes for WFO exports

ref #10273 some first steps for the WFO content export

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN) (cont. by adding authorshipCache as criteria)

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN) (cont. by adding also taxon uuid as criteria)

ref #7771 always use defined order for names that are the same in the name- or titlecache (e.g. MAN)

cleanup

minor

Revert "ref #7771: test adaption"

This reverts commit 9264d508afc6823675e7e541b3898ac9b795d9e0.

Revert "ref #7771: use representation of taxon rel type for display"

This reverts commit 89f511ab0ea7e38a282e9ff60f5e4ec0e460d40e.

ref #7771: test adaption

ref #7771: use representation of taxon rel type for display

set the test to ignore again

ref #7771: adapt TaxonRelationshipFormatter

ref #10178 exact matches score corrected

ref #10178 list of names as input

cleanup

use StringResultDto for ws result

ref #10322 add parameterless hql-result method to genericDao

cleanup

ref #10322: add countMethod to polytomouskey controller

ref #10322 fix data loading for test

ref #10322 add first test for PortalDtoLoader

ref #10322, #10474 add OccurrenceInfoDto

ref #10322 implement withXXX in PortalDtoLoader

ref #10471 split code for better debugging of NPE

fix NPE in association check

cleanup

fix potential NPE in TaxonNodeDto

cleanup

Check dao null exception

ref #10472 fix remote findDto method

ref #10472 add taxonFindDto search

ref #461, ref #9940, ref #9941 allow preceding type status label (and set as default)

revert model changes

replace by DASH_W (cont.)

replace by DASH_W

ref #461, ref #9940, ref #9941 add precedingMainType and accessionNoType params to type designation formatter

cleanup

ref #7045 fix test/incorrect object loading introduced for readonly test

ref #7045 use real DTOs for loading childNodesOf

cleanup

used defined uuid1

remove unused property path

#7045 move createNodeDtos to result class

ref #10472: add Methods to get accTaxonUuid and nom citation

ref #10322, ref #10474 order derivates on short label

extract SpecimenOrObservationBaseComparator

update javadoc for SpecimenTypeDesignationStatus

ref #10322, ref #10474 make SpecimenOrObservationBaseDTO.derivatives ordered

cleanup

remove unused getTaxaByName method from taxonDao

some javadoc

ref #10322, ref #10474 remove not fully implemented specimen implementation from DTO for now

ref #10322, ref #10474 use timePeriod instead of gatheringStartDate in all occurrence context

ref #10322, ref #10474 fix recordBase handling (cont.)

ref #10322, ref #10474 fix recordBase handling

ref #10322, ref #10474 handle contigFile

ref #10322, ref #10474 add DnaQualityDTO

ref #10322, ref #10474 add addAmplificationResultDTO, SingleReadDTO and PrimerDTO

ref #10322, ref #10474 cleanup fieldunit and improve data handling and comparison (cont.)

ref #10322, ref #10474 cleanup fieldunit and improve data handling and comparison

cleanup

ref #10322, ref #10472 further remove model objects, use DerivationEvent and some cleanup

ref #10322, ref #10472 remove defiend terms and OccurrenceType from SpecimenOrObservationBaseDTO

ref #10322, ref #10472 remove model objects from specimenDTOs

ref #10322 clean specimenDTOs and TaggedEntityReference factory method

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor (cont. ||)

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor (cont.)

ref #10322 split TypedEntityReference in data holder and factory class and remove deprecated constructor

cleanup

ref #10322 fix missing label for CollectionDTO

ref #10322 cleanup specimen DTOs

ref #10322 try to fix derivatives handling

Correct typo in ORCID IdentifierType description

ref #10273 add WfoContentExport classes (still dummy, copied from backbone export)

cleanup

reduce logging in CdmModelCacher

ref #9610: adapted io

ref #9610: adapted tests

ref #9610: MediaInfoFileReader should create inputStream only once

ref #10271 remove replacing of "wfo-" in WFO Identifiers (according to documentation change)

ref #10322 add javadoc for RegistrationDTO and RegistrationWrapperDTO

Cleanup

ref #10365: code cleaning

cleanup

Remove old FeatureDto_.java

ref #10322 split service DTOs to api DTOs and Loaders for specimen related DTOs; use SpecimenDTO in TaxonPortalDto

ref #10271 handle CURI identifiers separately

add EntityReference for secundum

ref #10271 handle ipni, tropicos and index fungorum identifiers

do not use feature if not contained in feature map

ref #10424 make getDefaultDescription transient

Updating develop poms back to pre merge state