renaming

organizing into subfolder

renamed file

*Added simple form validation

* code cleaning
* external css and js files

dynamical checkboxes through featureTree.json

dynamical checkboxes through featureTree.json
check for uuids instead of a simple string check

renamed test.jsp to export.jsp

*print redlist status from congruent concept relations

*code cleaning

Implemented to get several RedList Status from different related concepts

*handle file outputstream -> byteArrayoutputstream to write the output directly via the http response to the user's hdd
*clear memory of hashmap -> in order to be able to run the export various times
*prettyPrint method -> to print various result in one cell
*collect redlist status and print it

*Added ByteArrayOutputStream in order to be able to download a file and write the output directly to the user's hdd
*clean up of code basis

clean up code

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release cdmlib-parent-3.0.13

Removed the leading jdbc/ from the jndi bean name.

changed NonViralName to base TaxonNameBase to avoid deproxy

uri logging

removing offending import

fixing parent pom.xml

minor doc

fixing parent pom.xml

remove imports

reintegrating branch ikey-plus-import into trunk

correct handling for NULL values in ResultSetProxy

fix NPE with abbrev == null in Rank (II)

fix NPE with abbrev == null in Rank

xsl file locations configurable

introducing DataSourceProperties for making xsl file locations configurable

AM: removed useless assignment

introducing enum for Roles

securing GroupService and GrantedAuthorityService, simple tests for UserService security

replacing lucene-grouping classes by mvn dependency

fixing minor bug

fixing #2950 (Allow grouping of lucene (hibernate search) results)  - max score included

some more cleaning up

removing deprecated methods

almost 100% fixing #2950 (Allow grouping of lucene (hibernate search) results) - only max score is not yet available

first implementation: existing tests all Ok, grouping does not yet really work, index changes needed

adding lucene grouping module from svn.apache.org/repos/asf/lucene/dev/tags/lucene_solr_3_2/lucene/contrib/grouping/

remove old comment

add authentication to IO

add authentication to IO

move save for admin

adding authority to first user admin

javadoc

remove imports

toString for Collection

minor

now really fixing #3119 (fulltext search: Entity always null whatever search)

new enumeration CdmBaseTypes.java : Enumeration of all abstract CDM base types. Each provides a set of all sub types

latest Dwca export changes

Fix the highlighted text and the calculated score.

fixing #3119: fulltext search: Entity always null whatever search + regression test

tidying up

Added pages to vibrant-taxon.xsl

changed matchMode to BEGINNING. 'LIKE' currently not working.

Fixed presentation of score on results page.

Fixed broken link for source URL. Scratchpad taxons do not currently have a source URL so clicking the link just refreshes the current page.

fixing  #3117 (fulltext search: score values missing in results) and supplying maxScore

fixing #3116 (fulltext search: always only one page of results)

Regression test for #3116 (fulltext search: always only one page of results)

lucene upgraded to version 2.9.4

cleaning up

Dwca import update for references, synonyms with "parentNameUsage" and some minor stuff

Modified vibrant-taxon.xsl to display the results of the full text search.

Added a html page for calling the full text search.

#3113 (hibernate search: wildcard query can cause BooleanQuery: maxClauseCount is set to 1024) fixed by upgrade to lucene 2.9 + minor fix

comment

fixing NPE and test to reproduce #3113 (hibernate search: wildcard query can cause BooleanQuery: maxClauseCount is set to 1024)

upgrading to lucene 2.9 and fixing #3114 (fieldHighlightMap is empty with lucene wildcard searches) - code needs cleanup

fixing minor bug in SearchResultHighligther and test implemented for #3114 (fieldHighlightMap is empty with lucene wildcard searches)

avoiding id unnecessary fields in the lucene index

avoiding id duplication in lucene index, circumvents a bug in hibernate-search

index optimization and confirmed that there is nothing to fix for  #3063 (hibernate search: CdmMassIndexer.purge() fails, it does not empty the index.)

fixing #3115 (search method : TaxonServiceImpl.findTaxonByDescriptionElementFullText() is missing Distributions) + test for  #3063 (hibernate search: CdmMassIndexer.purge() fails, it does not empty the index.)

minor

use SpecimenDescriptionCacheStrategy

add SpecimenDescriptionCacheStrategy

fixing full text search issues: areas not found, etc

removing obsolete auhtority ALL.ADMIN

tuning off security relates logging noise

securing UserService on method level - all tests successful

simpler and more predictable persistence/query/MatchMode.java

implement classification filter on DwcA export

cdm_ws_progress.js moved from dataportal to cdmlib-remote-webapp

updating aspectj ant task to also use the java source code compliance level 1.6 => avoids the 'must override a superclass method' erros for @Override on interface method implementations

free text search: better querying for 'isNotNull' and code harmonization

rest service progress monitor refactored

very first version of some statistics classes

REST controller methods for new full text searches

fixing bug and re-enabling test method

ignoring failing test

refactoring a bit for clearer code

lucene union search aka multisearch implemented

initial multisearcher implementation (allows union like search on muliple indexes)