ref #7648 TaxonGraphService as dao and TaxonGraphObserver as TaxonGraphHibernateListener

ref #7648 TaxonGraphService complete with full set of tests

avoiding NPE when relationship type = null

ref #7648 initial implementation of TaxonGraphService with tests and TaxonGraphObserver

fix #7795 untilis xml DataSets can optionally be created without "[NULL]" values

minor issue with return type of listToTaxonRelationships() fixed

check for protected caches in cdmlight export

smaller changes in cdmlightexport

smaller changes in cdmlightexport

cleanup

remove unnecessary warning in cdmlight export

ref #7788 adding institutionTitleCache to RegistrationDTO

ref #7783  assuring registrations have an identifier when saved - adapting test

ref #7788 adding institution to RegistrationDTO

ref #7783  TaxonNamePart with uuid & assuring registrations have an identifier when saved

ref #7589 Fix initial loading of matrix

ref #7775 Fix source information in description titlecache

fix #7775 Add source information to description titlecache

add parental species ext to BerlinModelTransformer

cleanup

fix #7784 deduplicating and harmonizing ClassificationController methods

ref #7723 adding missing permission check to RegistrationServiceImpl to supress unpublished registrations

fix #7776 Add descriptive data set sources to specimen descriptions

Merge branch 'develop' into taxonDecription

ref #7345: add markertype commonNameReference

javadoc

ref #7745 filter getSynonymy for subtree - fix bug in checkExistsSubtreeAndAccess

ref #7745 filter getSynonymy for subtree - fix compile issue in cdmlib print

ref #7745 filter getSynonymy for subtree

return error if passing not existing classification uuid to taxon search web service

cleanup

ref #7674 Fix LIE

cleanup

fix #7767 fix wrong TagEnum for sec detail

Merge branch 'develop' into taxonDecription

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/5.3.0'

updating poms for branch'release/5.3.0' with non-snapshot versions

updating poms for 5.4.0-SNAPSHOT development

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

adding additional testcase for QueryFactory

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

Merge branch 'develop' into taxonDecription

fix #7764 revert incorrect tree parameter in search service and test for incorrect classification uuid

cleanup

ref #7764 fix failing synonym search with classification or subtree filter

allow nom status parsing without name (with ICNAFP as default)

ref #7761 add isInvalidDesignation to TaxonRelationshipType

ref #7761 add isInvalidDesignation to TaxonRelationshipType

make authenticationManager lazy to avoid circals during start up

fix #5868 restoring freetext search with leading wildcard and with empty query string, also fixes bug introduced while solving #4223

ref #7760 Show name authors for type designations

ref #7745 fix failing pathFrom if subtree is null

ref #7761: add isInvalidDeisgnation() method to taxon

ref #7745 upgrading springfox-swagger2 to circumvent bug related to @RequestMappings

cleanup

ref #7745 switch of required in getTaxonNodes

ref #7745 childNodesOf implemented

ref #7745 some exception handling for subtree filter

de-dublicating doGetTaxonNodes() controller methods

ref #7745 fixing workaround for override methods

ref #7745 workaround for duplicate TaxonPortalController getTaxonNodes Method

ref #7745 workaround for duplicate TaxonController get Method (for testing if this is the reason) for failing

ref #7745 workaround for duplicate TaxonController get Method (for testing if this is the reason) for failing

ref #7745 add subtree filter to missing methods (childNodesOf is still missing implementation)

cleanup

ref #7745 harmonizing subtree query parameters

ref #7759 additional TaxonNode webservice endpoint and solving logging problems

fix #7757 first freetext search test working for subtree filter

cleanup

fix #7757 removed all deprecated hibernate @Index (and @Table) annotations from model

ref #7745 implement treeindex search in freetext search (untested)

cleanup

rename AbstractRelationshipEdge.relationshipType to be more generic

ref #7745 add subtree parameter to freetext search methods

ref #7745 fix bug in queries with subtree, some first test and cleanup

ref #7745 fix syntax for node.treeindex in query

ref #7745 subtree filter to taxon search (add missing parameter for queries)

ref #7666 doGetTaxonRelationshipsDTO groupMisapplications paramter default = false

ref #7745 add subtree filter to taxon search (not yet tested for subtree != null)

fix #7756 allowig direction to be null again

ref #7745 add subtree filter also to ClassificationPortalListController

ref #7745 fix recursive call in deprecated method

ref #7745 implement subtree filter for ClassificationController.rankSpecificRootNotes and .childNodes

ref #7666 replace StringUtils dependency by correct one

ref #7666 allow formatting without name part (2. test)

cleanup

ref #7666 allow formatting without name part

avoid NPE when creating CollectionDto

ref #7666 fix team formatting (incorrect index of ambersand)

ref #6559: get and ordered list of MAN, proparte synonyms and invalid designations

ref #7674 Adjust description tag depending on marker type

ref #7674 Move aggregation service method to data set service

ref #7420 add config parameter to getWorksheetname for Excel import

ref #7674 Add service method for creating taxon description for data set

fixing ehcache.xml

ref #7742 disposable CdmCachers