upgrade unitils 3.3->3.4.2  #4636

additing titleCache to administrative area

fix bug for wrong StringUtils used in PresenceAbsence term

fix bug in TaxonNodeDaoHibernateImplTest.testSortindexForJavassist2

revert easymock -> 3.1 because of IllegalArgumentException: Partial mocking doesn't make sense for interface
upgrade xmlunit 1.4 -> 1.6
#4636

upgrade easymock 3.1 -> 3.3.1  #4636

upgrade junit-benchmarks 0.5.0 -> 0.7.2  #4636

upgrade junit 4.11 -> 4.12  #4636

adding first implementation for getting a csv file with all name informations

removing sql tracing from DescriptionDaoImpl

 - added image gallery to specimen details page

fix Index out of range Exception, #3910

inalizing implementing option to update the database scheme via cdmlib-remote, related to r19571

fixing  #4798 (NPE in DescriptionListController at descriptionElement/byTaxon?taxon={uuid})

removing invalid link from swagger-ui

whitespace

adapting the setters of attributes with @NullOrNotEmpty annotations #4653

fixed typo

corrected link to maven repo

 - fixed parameter assignment with no effect

 - added findOccurrences() and countOccurrences() to service layer
 - added configurator for these methods
 - optimized retrieval with HQL query
 - made use of service method in DerivateSearchView

 - fixed recursive method

whitespace

allowing to use the freetest search with empty query strings, so that only the additional search filters are taken into account

order area terms DTOs by idInVocabulary

fixing NPE in TaxonPortalController.doGetSubtreeMedia() for the request path taxon/{uuid}/subtree/media

adding source folders

 - reverted temporary changes for titleCache generation

fixed request parameter to match the convention of using the pathvariable

 - added wrapper for map service query to have access to the data points
 - used data points as parameters for the bounding box of the point distribution map

 - temporarily disabled test

 - quick&dirty copy&pasted getMostSignificantIdentifier() to facade cache strategy

 - fixed some design issues

 - fixed citation string and specimen determination string in portal assembly

 - fixed potential NPE

 - fixed dateString assembly for compressed specimen table

quick fix for cache strategy exception. Cache strategy not yet correctly created. #4773

first implementation of team->person->team conversion #4769, #4770

Fix merging of names of different types test

allow different type merging not only for reallocation of links

minor

clean up AgentService

minor

remove onlyReallocate links as this is not yet implemented  #4768

Make deduplication of TeamOrPersonBase possible in cdmlib #4768  and solve test problem in CdmGenericDaoImplTest #2096, finding some bugs in between

 - added service method to get the most significant identifier for a derived unit
 - added character data icon to specimen table
 - fixed derivate flags in DTO assembly

 - added specimen citation, associated taxa and typed taxa to specimen page (#4765)

 - get accessionNumber from specimen identifiers in this order accNo>barCode>catalogNumber
 - refactored PHP
 - added flag for specimen page in compose function

 - fixed potential NPE
 - fixed herbaria assembly

add O'Connor and zur Strassen as parsable authors.  #4759

 - added setter

add new UTF8 characters

Fixing failing search test, using better utf8 handling

correct handling of terms with multiple representations

implementing better namedAreasInUse service for  #3994 (Select widget to choose the filter areas for the advanced search)

fixing broken characters

implement clone for SingleReadAlignment

minor

first implementation of WrappedCdmDataSource #3910

no null return type even safer

 - added generic method for specimen details used in table and details page

 - fixed potential LIE

 - fixed potential null values
 - added uuid to preserved specimen dto

get Shift always returns empty array instead of null   #4734

remove imports

minor cleanup

 - refactored DTO assembly for compressed specimen table in the data portal
  - now data is assembled for each individual preserved specimen and the for the parent field unit

make indexing type collection a list (was Set before)

add tests to avoid inconsistencies in recursive cdm updater calls

minimum maven version back to 3.0.5

lowering minimum maven version to 3.0.4

bugfix for 34_341 Updater

new launchers for JettyLauncher plugin, also new structure in ide folder

setting minimum maven version to 3.0.5 and specifying missing version of maven-project-info-reports-plugin

add test for disassamble

remove failing sqlType test

handle empty Shift #4734

merge validation commits r23146, r23162, r23163 into trunk

merge r23161 into trunk

merge r23145 into trunk

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release cdmlib-parent-3.5.0

decoupling version of cdm-vaadin, to solve problems in the maven release:prepare phase

ignoring .settings

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release cdmlib-commons-3.5.0

add Transient to getNullSafe methods and make MarkerType not null Level2 rule

Improved parser for zoological names...

minor

fix bug in update script