adding lucene grouping module from svn.apache.org/repos/asf/lucene/dev/tags/lucene_solr_3_2/lucene/contrib/grouping/

remove old comment

add authentication to IO

add authentication to IO

move save for admin

adding authority to first user admin

javadoc

remove imports

toString for Collection

minor

now really fixing #3119 (fulltext search: Entity always null whatever search)

new enumeration CdmBaseTypes.java : Enumeration of all abstract CDM base types. Each provides a set of all sub types

latest Dwca export changes

Fix the highlighted text and the calculated score.

fixing #3119: fulltext search: Entity always null whatever search + regression test

tidying up

Added pages to vibrant-taxon.xsl

changed matchMode to BEGINNING. 'LIKE' currently not working.

Fixed presentation of score on results page.

Fixed broken link for source URL. Scratchpad taxons do not currently have a source URL so clicking the link just refreshes the current page.

fixing  #3117 (fulltext search: score values missing in results) and supplying maxScore

fixing #3116 (fulltext search: always only one page of results)

Regression test for #3116 (fulltext search: always only one page of results)

lucene upgraded to version 2.9.4

cleaning up

Dwca import update for references, synonyms with "parentNameUsage" and some minor stuff

Modified vibrant-taxon.xsl to display the results of the full text search.

Added a html page for calling the full text search.

#3113 (hibernate search: wildcard query can cause BooleanQuery: maxClauseCount is set to 1024) fixed by upgrade to lucene 2.9 + minor fix

comment

fixing NPE and test to reproduce #3113 (hibernate search: wildcard query can cause BooleanQuery: maxClauseCount is set to 1024)

upgrading to lucene 2.9 and fixing #3114 (fieldHighlightMap is empty with lucene wildcard searches) - code needs cleanup

fixing minor bug in SearchResultHighligther and test implemented for #3114 (fieldHighlightMap is empty with lucene wildcard searches)

avoiding id unnecessary fields in the lucene index

avoiding id duplication in lucene index, circumvents a bug in hibernate-search

index optimization and confirmed that there is nothing to fix for  #3063 (hibernate search: CdmMassIndexer.purge() fails, it does not empty the index.)

fixing #3115 (search method : TaxonServiceImpl.findTaxonByDescriptionElementFullText() is missing Distributions) + test for  #3063 (hibernate search: CdmMassIndexer.purge() fails, it does not empty the index.)

minor

use SpecimenDescriptionCacheStrategy

add SpecimenDescriptionCacheStrategy

fixing full text search issues: areas not found, etc

removing obsolete auhtority ALL.ADMIN

tuning off security relates logging noise

securing UserService on method level - all tests successful

simpler and more predictable persistence/query/MatchMode.java

implement classification filter on DwcA export

cdm_ws_progress.js moved from dataportal to cdmlib-remote-webapp

updating aspectj ant task to also use the java source code compliance level 1.6 => avoids the 'must override a superclass method' erros for @Override on interface method implementations

free text search: better querying for 'isNotNull' and code harmonization

rest service progress monitor refactored

very first version of some statistics classes

REST controller methods for new full text searches

fixing bug and re-enabling test method

ignoring failing test

refactoring a bit for clearer code

lucene union search aka multisearch implemented

initial multisearcher implementation (allows union like search on muliple indexes)

test for TaxonService.findByFullText() successful

a bit more cleaning up

introducing the QueryFactory for to modularize lucene query building

minor

deprecate isNotEmpty and new isNotBlank method

test commit

getSpecimenDescription for import base and some minor changes

reverting erroneously commits r16027 to r16031

initial working version of ikeyplus import

initial multisearcher implementation (allows union like search on muliple indexes)

test for TaxonService.findByFullText() successful

a bit more cleaning up

introducing the QueryFactory for to modularize lucene query building

make BMTransformer not public

update logging for inInReferences in BM import

update for Campanula import

implementing GrantedAuthorityService for #2990 (implement missing parts of Groups admin details view)

bugfix for finding eol agents converter

updating generics and bugfix for finding eol agents converter

add EOL_Agent converter

add EOL_Agent converter

Some bugfixes for the DwcA import

bugfix for failing dwca description import

preparations for secutity implementation in taxeditor ApplicationController

minor

leave empty descriptions

description transformer for emonocots

remove uncompiling bug, still incorrect

add dwca import transformer for features

implement description in DwcA

getFeature in Dwca import public

implement getFeature for DwCA import

fixing #3094 (security: make PermissionEvaluator and/or methods available via ApplicationController) & also removing hasPermission() from IService

minor

better reporting for missing field entry in DwcAin

add exception for file is missing

cleaning up spring context configuration

add modifier handling to imports

add statistical measure handling to imports

new Factory Method for StatisticalMeasurement

add measurement unit handling to imports

fixing #3079 (security: implement DELETE in CdmSecurityHibernateInterceptor)

splitting up long test methods