try to fix tests

cleanup

cleanup

cleanup

fix incorrect handling of null lists and boolean operator in NameCatalogueController

cleanup

ref #7478 add test to pro parte hql search

cleanup

remove harmonization candidates in TaxonDao and NameService

cleanup

ref #3547 cleanup and remove size of TaxonDaoHibernateImplTest.testGetTaxaByNameAndArea.xml

improve readability of test and fix test for common names

fixing minor logging issues in catalogue controllers

fixing minor logging issues in controllers

ref #7478 simplify taxon hql search code

cleanup

dedicated private loggers per controller class for more useful logs

dedicated private loggers per controller class for more useful logs

ref #7478 some cleanup and renaming for taxon hql search

ref #7478 fix pro parte synonym search in taxon hql search (still untested)

cleanup

corretly handle exception in ClassificationPortalListController

ref #4101 change ICNB and ICNAFP in order of enum to get a more alphabetically oriented order.

smaller changes for longrunning tasks and progress monitor

cancel the longrunning thread cancels moveTaxonNode and set it to rollbackOnly

check in done() in remotingProgressMonitor whether result is already set

cleanup

ref #6321 Make OrderHint serializable

progressmonitor should be set to done by progressMonitorThread not in service methods

fix problems with progress monitor

remove progress monitor thread from progress monitor

revert changes in cleanupThread of progressMOnitorManager

remove monitorThread from monitor and handle it in progressMonitorManager

ref #7463: do not move children of a moved node to the new parent but keep it as children

ref #7463: add only moved nodes to resultSet of moveTaxonNodes

ref #7487 set test to ignore

ref #7487 fix ticket number 7486->7487

ref #7486 create test for pro parte search issue

cleanup

fix pro parte/partial test data labels

rel #7478 implement pro parte synonym search in free text taxon and name search

cleanup

fix #7486 fix taxon full text search if doTaxon is missing

Unignore tests

cleanup

ref #7334 add pro parte and partial synonym to test terms

ref #7223  ReferencePropertyDefinitions adding Journal which has been lost in last commit

ref #7223  ReferencePropertyDefinitions adding Proceedings and code cleaning

ref #7223  ReferencePropertyDefinitions documentation and fixing field name

Adjust specimen type designation display

ref #/7223  ReferencePropertyDefinitions provides field and property name information per reference type

fix #7445 fix csv reading for uri and isoXXX in terms

ref #3560 fix includeUnpublished for taxon relationships and correct includePublished->includeUnpublished

ref #1080 removing commented @IndexedEmbedded from Reference.inReference

re-enabling MobotOpenUrlServiceWrapperTest.testDoResolveAndPage_1()

use long instead of int (cont.)

use long instead of int (cont.)

use long instead of int (cont.)

use long instead of int in some of the count methods, use base methods for pageSize/number and order for criteria and queries, cleanup

minor

cleanup

ref #3560 add includeUnpublished for taxon relationships

cleanup and remove rows(xxx) method

fix #7467 taxon name parts lookup method with support for wildcard searches, TaxonNameParts and filter

updating deprecation information on methods using int for hibernare result count which is now long

startH2Server documentation

fixing problems with startH2Server documentation

fixing problems with startH2Server and providing feedback to developers on start up

ref #3560 fix wrong method call in BaseController

ref #3560 remove unpublished synonyms from taxon.synonymy (handle homotypic syns correctly)

cleanup

ref #3560 handle access denied for unpublished data in BaseController.doGet

ref #3560 remove unpublished synonyms from taxon.synonymy (fix)

ref #3560 handle access denied for unpublished data in some TaxonController methods

cleanup

ref #3560 remove unpublished synonyms from taxon.synonymy

ref #3560, ref #5477 fix missing lucene index update for synonyms and misapplied names

ref #3560 further improve full text taxonAndName search for publish flag, including tests

cleanup

potentially fix uuid query factory method

cleanup

ref #5974 fully remove multi value field logic from AcceptedTaxonBridge

adapt test

add test for misappliedname problem with type desinations

ref #3560 try to add publish to synonym search in findTaxaAndNamesByFullText (probably not working yet)

cleanup

ref #5974 fully remove multi value field logic from AcceptedTaxonBridge

cleanup

smaller changes in taxon list import

fix in getUuidAndTitleCache

cleanup

minor

fix #7469 fix column type changer for Postgres

fix #7468  fix update script for mediaCreated in PostGreSQL

Increase platform-site-skin version

remove confusing code

ref #3560 further publish flag issues for lucene search and first tests on lucene search

cleanup

ref #3560 fix pathFrom in classification service impl

ref #7466 adding marker type NOMENCLATURAL_RELEVANT