ref #7709 JUnit testsuite to reproduce the test failure when running RegistrationIdentifierMinterTest and TaxonGraphHibernateListenerTest sequentially

cleanup

Change system.out to log.info()

ref #7648 free configurable TaxonGraphHibernateListener ready

ref #7648 moving TaxonGraphHibernateListener and related classes into cdmlib-service

ref #7648 TaxonGraphHibernateListener as Spring bean configured via the CdmHibernateListenerConfiguration

fixing usage of wrong logger in RunAsAuthenticator

sanitizing contoller method doGetIncludedTaxa

ref #7793: preferencePredicate for mediaview and checklist perspective

ref #7799 handle initials for teamOrPerson.getFullTitle

ref #7799 handle protected titlecache for teamOrPerson.getFullTitle

cleanup

add new preferencePredicates

commenting createTestDataSet() @Test annotation

ref #7648 automatic management of lower ranked names in the taxon graph

Merge branch 'feature/#7648' into develop
 - TaxonGraphDao
 - TaxonGraphController
 - TaxonGraphService
 - TaxonGraphDTO
 - TaxonGraphHibernateListener and processor
 - tests

ref #7648 fixing problems in TaxonGraphTest

ref #7791 TaxonGraphDao supressing Names associated with Registrations where the status is not PUBLISHED

ref #7648 moving taxongraph methods from taxonDao to taxonGraphDao

ref #7791 TaxonGraphNodeDTO with rank labels

ref #7648 more pulling up into AbstractHibernateTaxonGraphProcessor

ref #7648 common base class AbstractHibernateTaxonGraphProcessor to deduplicate TaxonGraph methods

ref #7648 allowing to set the TaxonGraphHibernateListener inactive  - only for test environments

ref #7648 allowing to set the TaxonGraphHibernateListener inactive  - only for test environments

ref #7648  solving session corruption problems in test suite for TaxonGraphHibernateListenerTest

ref #7648 fixing inconsistency in test data and improving logging

ref #7791 using name.titleCache as title for TaxonGraphNodeDTO

adapt CdmPermissionClass

cleanup

ref #7791 TaxonGraphService and TaxonGraphController implemented

ref #7648 correct handling existing taxa without secReference

ref #7648 introducing CdmPreferenceLookup for cached access to the CdmProperty with predicate 'TaxonGraphSecRefUuid' and others
  - using this Preference in TaxonGraphDaoHibernateImpl and TaxonGraphBeforeTransactionCompleteProcess
  - adapting tests accordingly
  - deprecating secRefUUID setters
  - cleaning up

ref #7648 cleaning up and attempting to fix TaxonGraphService test setup

ref #7648 all TaxonGraph updating done in a BeforeTransactionCompletionProcess implementation - TaxonGraphHibernateListener is working now

ref #7648 TaxonGraphService as dao and TaxonGraphObserver as TaxonGraphHibernateListener

ref #7648 TaxonGraphService complete with full set of tests

ref #7345: fix dao method to get entities with special marker and pattern in titleCache

ref #7345: add dao and service methods to get UuidAndTitleCache marked with a special markerType

avoiding NPE when relationship type = null

ref #2764 ref #3817 move negative endemism states down in order

ref #4822 use specific annotation type for distribution information

cleanup

ref #2764 ref #3814 add endemic non and unknown status

ref #7648 initial implementation of TaxonGraphService with tests and TaxonGraphObserver

fix #7795 untilis xml DataSets can optionally be created without "[NULL]" values

minor issue with return type of listToTaxonRelationships() fixed

check for protected caches in cdmlight export

smaller changes in cdmlightexport

smaller changes in cdmlightexport

cleanup

remove unnecessary warning in cdmlight export

ref #7788 adding institutionTitleCache to RegistrationDTO

ref #7783  assuring registrations have an identifier when saved - adapting test

ref #7788 adding institution to RegistrationDTO

ref #7783  TaxonNamePart with uuid & assuring registrations have an identifier when saved

ref #7589 Fix initial loading of matrix

ref #7775 Fix source information in description titlecache

fix #7775 Add source information to description titlecache

add parental species ext to BerlinModelTransformer

cleanup

fix #7784 deduplicating and harmonizing ClassificationController methods

ref #7723 adding missing permission check to RegistrationServiceImpl to supress unpublished registrations

fix #7776 Add descriptive data set sources to specimen descriptions

Merge branch 'develop' into taxonDecription

ref #7345: add markertype commonNameReference

javadoc

ref #7745 filter getSynonymy for subtree - fix bug in checkExistsSubtreeAndAccess

ref #7745 filter getSynonymy for subtree - fix compile issue in cdmlib print

ref #7745 filter getSynonymy for subtree

return error if passing not existing classification uuid to taxon search web service

cleanup

ref #7674 Fix LIE

cleanup

fix #7767 fix wrong TagEnum for sec detail

Merge branch 'develop' into taxonDecription

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/5.3.0'

updating poms for branch'release/5.3.0' with non-snapshot versions

updating poms for 5.4.0-SNAPSHOT development

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

adding additional testcase for QueryFactory

ref #7745  fix failing freetext search in facts freetext search

Merge branch 'develop' into taxonDecription

fix #7764 revert incorrect tree parameter in search service and test for incorrect classification uuid

cleanup

ref #7764 fix failing synonym search with classification or subtree filter

allow nom status parsing without name (with ICNAFP as default)

ref #7761 add isInvalidDesignation to TaxonRelationshipType

ref #7761 add isInvalidDesignation to TaxonRelationshipType

make authenticationManager lazy to avoid circals during start up

fix #5868 restoring freetext search with leading wildcard and with empty query string, also fixes bug introduced while solving #4223

ref #7760 Show name authors for type designations

ref #7745 fix failing pathFrom if subtree is null

ref #7761: add isInvalidDeisgnation() method to taxon

ref #7745 upgrading springfox-swagger2 to circumvent bug related to @RequestMappings

cleanup

ref #7745 switch of required in getTaxonNodes