use default init as advanced stil creates error

minor

remove non compiling import from Advanced Initializer

latest changes for bean initializer (including auto initializers)

fix country voc uuid bug

adapting tests to modified cyprus map request parameter creation

using origial OrderHint.NOMENCLATURAL_SORT_ORDER in REST controller

using origial OrderHint.NOMENCLATURAL_SORT_ORDER in REST controller

fixing sort order problem with lucene search

introcducing NomenclaturalSortOrderBrigde

removing almost all hardcoded cyprus specialties

fixing bugs regarding the shape file mapper as preparation for removing hardoded layer information for cyprus

adding assertion to tests

 - fixed copy&paste mistake

javadoc

add hql method to GenericDao  (not clean yet)

latest changes to bean initializing

latest changes

add RemoteTester (not yet ready)

revert r19380

revert r19380

revert r19380

minor

remove override for testing

change DescriptionBase.descriptionElements to DescriptionBase.elements   #3841

remove getVocabulary(Enum) and add overrides

remove invalid originalNameString

minor

improve logging and change signature for PersistentTermInitializer

improve logging and change signature

update toString for distribution class

update java doc

minor

minor javadoc

fix term loading bug

remove commented code

rename term initializer method

some Java doc for new term loading

add country vocabulary

add logging for failing test  #3831

fixing test for missing terms

minor

refactor term loading for performance

minor

minor

Use column annotation to define size of columns

minor

fix not running ABCD import test, still needs further fixing for OriginalSource handling

minor

fixing problem with dialect

switch back to MyISAM as InnoDB still creates a couple of problems.   #3371

merge branch io into trunk for ABCD import

test taxon title cache generation #3833

test taxon title cache generation #3833

Added call to new MediawikiOutputModule constructor.

Added text to credit the CDM source database and added citations for description elements.

service adaption for deletion of a selection of taxonnodes

fix name of SpecimenOrObservationType.message for Unknown

reintegrate io branch into trunk

merge patricia branch into trunk for cdmlib-io

add deleteTaxonNode service method

set default of supportsTextData to true:  #3829

change logging

move to width first initialization in Advanced Init

fix BeanInitTree and remove call of old initializer

add call of old bean initializer again

try to fix bug with method cache

remove call of old bean initializer

use single method cache

switch to AdvancedBeanInitializer again

fix autoinitializer bug in AdvancedBeanInitializer

revert to DefaultTermInitializer

switch to AdvancedBeanInitializer (also in persistence xml)

switch to AdvancedBeanInitializer

creating AdvancedBeanInitializer first step (InitNode tree and some clean up)  - in work

initial state

make logger private

minor

test if we can remove description from the taxon init strategy in taxon controller  #3825 (3)

minor

minor

minor

profiling for description dao

IGNORE areas for which no layer is mapped

removing unnesscary default baselayers - finally deleting commented lines

make observer list modifiable #3825 (task1)

reintegrate branch patricia into trunk

make observer list modifiable

minor

Handle user types in getReferencingObjects

remove System.out

removing unnessecary casts

commenting also method with important information related to #965 (Return type of partOf, kindOf etc. has to be decided)

 - DefinedTerm is ordered as in enum (#3752)

Setting PublisherTest to Ignore as it's breaking build in Jenkins.

reintegrating mediawiki export

commit after merge from trunc

Fixed method causing mvn build error.