Increase platform-site-skin version

remove confusing code

ref #3560 further publish flag issues for lucene search and first tests on lucene search

cleanup

ref #3560 fix pathFrom in classification service impl

ref #7466 adding marker type NOMENCLATURAL_RELEVANT

make moveTaxonnodes a longrunning task

cleanup

ref #3560 add publish flag to lucene search

cleanup

cleanup

ref #3560 add publish flag to lucene index

cleanup

ref #3560 implement loadTreeBranchToTaxon (pathTo) for unpublished

cleanup

removing useless component scan for eu/etaxonomy/cdm/search

ref #3560 set includeUnpublished as default for FindTaxaAndNames configurator

ref #3560 implement publish in taxon service by name search

ref #3560 implement publish in taxon service by name search

cleanup

ref #3560 tests for unpublished listRankSpecificRootNodes

ref #3560 implement unpublished in BaseController.doGet

cleanup

ref #3560 implement unpublished for listSiblings in service and remote (no tests yet)

ref #3560 implement unpublished for rankSpecificRootNode in service and remote (no tests yet)

cleanup

ref #3560 implement unpublished for taxon collection retrieval in occurrence service

ref #3560 unpublished for doGetTaxonNodes and doGetTaggedName and doGetSubtreeMedia

ref #3560 implement unpublished for load and find in service layer

ref #3560 use global "unpublished" constant

cleanup

ref #7447 DescriptionElementBase.clone for inDescription

cleanup

ref #7446 add extension already exists check to IdentifiableEntity

fix #7445 make empty term uris null

ref #7340 make DeterminationModifier and Sex default vocabularies unordered

cleanup

cleanup

ref #3560 implement publish filter for ClassificationDao.listChildrenOf and .countChildrenOf

cleanup

ref #3560 implement publish filter for TaxonNodeDao.listChildrenOf and .countChildrenOf

cleanup

minor

ref #6945 use E+M vocabulary for marker types

ref #7334 fix missing table attributes in CDM light export for pro parte synonyms and misapplied names

ref 3984: add persistence method to get uuidAndTitleCaches for a list of uuids

ref 3984: add service method to get uuidAndTitleCaches for a list of uuids

minor

minor

adapt longrunningTasks service for all subtree operations

ref #7434: remember sequence uris for downloading the files at the end of the import

adapt source reference in ABCD import

fix #7433: get specimen by genetic accession number

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/5.0.0'

updating poms for branch'release/5.0.0' with non-snapshot versions

change v in develop poms 4.16->5.1

change version from 4.15 => 5.0 in cdmlib release

ref #6752, ref #6627 fill verbatimDate in CDM light

ref #6752 return type for setDatePublished(TimePeriod) and set to deprecated

updating poms for 4.16.0-SNAPSHOT development

ref #6752 fix NPE in VerbatimTimePeriod parser

ref #6752 stricter handling of Reference.setDatePublished (only for calling methods)

cleanup

ref #6752 first implementation of VerbatimTimePeriod parser

ref #6752 toString for VerbatimTimePeriod

ref #6752 strictly use VerbatimTimePeriod where possible

ref #7334 error handling in update script for pp synonyms

ref #6752 strictly use VerbatimTimePeriod where possible

ref #7334, ref #6627 Adapted CDM light to support pp synonyms (cont.)

add also partial misappliedNames to computeMisapliedNameRelations

javadoc

ref #7334 update cached model for removed partial and pro parte

ref #7335, ref #7334 remove getProParteSynonyms method (is more or less duplicate)

ref #7334 remove proParte and partial from Synonym class

ref #7334 adapt DwCA and CDM light export to new pro parte synonym handling, also add misapplied name handling to CDM light

ref #7334 add convenience methods for pro parte and partial synonym to Taxon and TaxonRelationshipType

add annoations to FullCoverageDataGenerator Registration

add partial misapplied name to test data

remove createSynonym method

add methods for Pro Parte synonyms

ref #7362 Add service method which also saves the new feature

ref #6526 Fix generics of comparator

ref #6588 include ExternalLink in FullCoverageDataGenerator and some new factory method

cleanup

Add SchemaUpdater_50_51 and remove mediaCreatedOld (ref #7414)

ref #6699 update script for delete term version

ref #2335  add DTYPE update to DescriptiveDataSet renaming

add createsynonym method to service

fix typo in uuidAndTitleCacheTaxonComparator

minor changes for CdmModelCacher

ref #7109 update test data for nom. val. and in parser

add service for creation of synonyms (fixing saving of hybrids)

workaround for very strange max(id) behavior in remote-webapp H2 test database

cleanup

update CDM model cache (cdm.map.ser) to 5.0

update H2 Test DB in remote webapp

ref #6588 adapt fix test schema