ref #8321 cleaning up cotroller code

smaller changes in ABCD import - continue

Merge branch 'develop' of ssh://dev.e-taxonomy.eu/var/git/cdmlib into develop

smaller changes in ABCD import

ref #8182: minor

ref #8182: accession number is required in webservice

ref #8182: add header to failed response

ref #8182: handle not existing dna for accession number

cdmlight: change area category to the area level

ref #8248 Add feature to export (partially)

ref #8248, #6774 Add character to export

 - adapt test

ref #8248, #6774 Add sources to import/export

ref #8248, #6774 Improve import/export performance

ref #8335 Add character matrix table state DB preference

add hybrid name save to import base class

add E+M rank uuids to rank class

Merge branch 'develop' of ssh://dev.e-taxonomy.eu/var/git/cdmlib into develop

set dnaSource to null in test

ref #8248, #6774 Add progress monitor to import/export

smaller changes in abcd import and cdm light export

ref #6774 Add progress monitor to owl export

ref #8248, #6774 Add media to import/export

ref #8248 Only add term to vocabulary if term is newly created

ref #8248 Only add term to vocabulary if term is newly created

ref #8248, #6774 Add plural to import/export

 - add test for plural and abbrevLabel

ref #8248, #6774 Add symbol, symbol2 and idInVocabulary to import/export

 - change rdf identifier to lowercase

fix #8257 remove remaining deprecated FeatureNode.NewInstance method

overwrite equals for taxonnodeDto

ref #8047: configurable display of status in drop down, new enum and predicate

ref #8321 implementing page by restriction method to allow for flexible web service queries, also protecting unpublished taxa and names ref #3560

add rollback check in ExcelImportBase

fix compilation error in BaseListController

fix test as cdm light creates all tables now

generic webservice method for all cdm entitiy list controllers to search by Restriction

ref #8322: adapt TaxonNodeDtoComparator to compare the names by taggedTitle

ref #5857, ref #8319 adding TypedEntityRefernces to nom status TaggedText and fixing json serialization for EntitiyReferences in taxon.taggedTitle processing

fix #8319 NomenclaturalStatus webservice and according service methods implemented

fix #8314 implementing taxonname.taggedFullTitle for model class and in web service controller

ref #8273: check for DNA data for provided biocase provider

minor

ref #8182: adapt occurrence DTOs to use them in details page of blast result

ref #8045: add toString() to the preference enums

ref #8248 Add term vocbulary import test + code cleanup

ref #8248 Fix property string access

ref #6774 Init export configurator

ref #8248 Adapt test to import

ref #8248 Set UUID during import

ref #6774 Adapt test to export format

fix tests for cdmlight

fix preference service

ref #8248, #6774 Fix bean names

ref #8045: add remove to preference service and dao

ref #8248 Implement termvocabulary import

ref #6774 Set vocabulary for partOf and kindOf terms in export

ref #6774 Fix node hierarchy in export

ref #8248 Extract CDM entity creation to util

ref #8248, #6774 Extract model creation form import and export to util

ref #8248 Move rdf model to import state

ref #6774 Use UUID for feature tree export

ref #6774 Fix class cast exception

ref #6774 Add service method findVocabularyDtoByTermTypes()

ref #8209 modularization of reference init strategies - bug fix

ref #8209 modularization of reference init strategies

ref #8209 modularization of reference init strategies and improving EntitiyInitStrategy class

minor

fix sortindex in cdmlight export

ref #6774 Refactor export class inheritance

ref #6774 Extract all resource creation to util class

adapt IdNamespace predicate a bit #8294

ref #6774 Bidirectional linking of terms and vocabularies

ref #6774 Add util class for static methods

Set vocabulary DTO when creating a term DTO

ref #6774 Refactor term tree export

 - unify resource creation methods

ref #6774 Implement term vocabulary OWL export (partially)

ref #6774 Use term node uuid for node resource

ref #8252 preserving section authors and better title compentation

add some term uuids to E+M import

ref #8286 add centimeter to MeasurementUnit

ref #8189 adapt tests for ConfigFileUtilTest

ref #6774 Refactor OWL export

 - move OWL model to export state

minor

fix sortindex for root nodes and harmonize column names

add check for dna data

ref #7966 preparing web service contollers to search for NULL type status via UUID parameter

fixing NPE in TypeDesignationStatusFilter processing when '- none -' is selected

fixing wording in logging

fix #8279 avoiding ClassCastExceptin in CdmUserHelper

revert commit e358ae186 and adapt return type

add E+M common name area voc uuid

ref #8189 fix user.home in AccountStore

use state in getVocabulary

fix findTitleCache in service layer

ref #7470 preliminary set text to transient in TextualTypeDesignation

make referenceTitleCache index consistent

ref #7470 preliminary set isVerbatim to transient in TextualTypeDesignation

ref #7470 add TextualTypeDesignation.isVerbatim to test schemas

ref #7470 add TextualTypeDesignation to hibernate.cfg

ref #6774 Export term vocabulary for each term

ref #6774 Refactor export for multiple term trees

minor