bugfix for MA workaround

dirty workaround bugfix for #2743

add a test for a search only for misapplied names

fix for #2648

circumventing persisting problems in test

add switch species group

add switch species group

test to reproduce bug in #2648 (search for misapplied names implemented)

fixing bug in bugfix for  #2648, also fixing tests

fixing bug in #2648: search for misapplied names implemented

bugfix (#2648)

test to reproduce bug in misapplied name search

remove whitespace

handling blank strings as null

minor

minor logging improvements

minor logging improvement

minor (logging)

minor (logging)

launch configs updated to new runjettyrun version

documentation

fixing bug associated with getTaxaByCommonName(); benchmarking taxa by common name hql vs lucene

exclude updated_when from TaxonName

Object change mapper for PESI and empty epithet bugfix and empty hybrid formula bugfix

hibernate fulltext search & refactoring getTaxaByName*() method headers

move DbExportMappers to common.mapping.out

refactor export mapping

countTaxaByName harmonized with find method (replace Class <? extends TaxonBase> parameter with boolean parameters for synonyms, taxa and misapplied names)

bugfix compile error in SOurce

minor

more generic for export io classes

some library updates for PESI export

return type for getTaggedText

convenience methods to TaggedText and TagEnum

toString for TaggedText

changes for bugs and problems in search for misapplied names (#2648)

use io application controler

minor

better logging for occurrences missing source number

Added MODIFIABLE to MarkerType and MarkerType.csv

update erms import (e.g. lsid mapper)

bugfix for ordered term import

latest version of delete result

base class for delete configurator

new term delete implementation

minor

handling missing id case for object creation mapper

improve error handling for SQException

improve error handling in for no such method exception

improve logging for errors in mapper (not yet finished)

improve error message for exceptions in ResultSetPartitioner

error handling send to logger in import mapper

improved logging for ordered terms compare

bugfix for common name import

bugfix for webmarker import

minor

improve logging for OrderedTerm compare

bugfixes for CommonNameImport and WebMarkerCategory import

log missing occurrence source references in one set

some improvements on taxon relation logging

some logging improvements for common names

minor

change order of AuthorTeam filter calls (maybe this reduces deadlock probability)

turning System.err into logger.debug

webservice portion of #2648 (search for misapplied names implemented)

Bugfix for filtered AuthorTeam import

fixing aspectj compile time error

pom forgotten - sorry

bugfix for authorTeam filter

add author and authorTeam Filter

improve common name import

add includeEmpty vocs (#2704)

rename DeletionResult -> DeleteResult & improve TermDeletionConfigurator

added deletion result class and term deletion configurator #2703 and others.

implement getTermVocabulariesByTermClasses also for subclasses (#2704)

added EM areas turkey and caucasia

bugfix for occurrenceSource import filter

Single classification for E+M import && some occurrence import fixes

some bugfixes for E+M import (occurrences, occ sources, webmarker)

bugfix for commonName import

harmonising whitespace tab->space

harmonising whitespace tab->space

lucene search: multi instance configuration fixed, native lucene search, ....

filtering common names and updating validation

bugfix for name status import

add filters to some validations

refactor reference import

bugfix for nameFacts, nameStatus and nameRel import

minor

add occurrence filter for BM export (2)

add occurrence filter for BM export

bugfix for facts filter

minor

some more filter on nameFacts, nomStatus, reference and taxonNameRel for BM export

improve facts filter for BM import

add facts filter for BM import

minor