move TaxonNodeSortMode to model.compare

cleanup

ref #9276 renaming DerivationTreeSummaryDTO fields in SpecimenOrObservationBaseDTO

ref #9276 documenting DerivateDataDTO and renaming to DerivationTreeSummaryDTO

try to fix TaxoNodeByNameComparator issue in application context files.

fix compile error and rename TaxonNodeNaturalComparator

moving further Comparators to model.compare

cleanup

ref #9354 fix NPE in TaxonNodeByRankAndNameComparator

ref #9395 adapting services and web-services to return all root units

move some comparators to model.compare package, add subpackages to model.compare and  some cleanup

implement Comparator contract for TypedEntityComparator.java correctly

fix compile error

improve generics for AgentService.getUuidAndAbbrevTitleCache

cleanup

ref #9356 adapt TypeDesignationComparator to fix case when both type status are null ; and cleanup null compare part above

cleanup and improve generics

fix delete taxon/name and merge createTaxon methods - continue

cleanup

ref #9142 code simplification

ref  #9301 extending init-strategy to include typeDesignation.source.*

merge the two create taxon methods

fix isDeletable for taxon with name used only once

ref 6308: result should be ok, if taxon can be deleted but not the name

ref #7223 proper definition of IPersonalCommunication in ReferencePropertyDefinitions

ref #9290 castTo method for TypedEntityReference

fix #9391: fix test

ref 6308: check for namedeletion in taxonbase isDeletable and add warning if not deletable

fix #9391: fix test

fix #9391: if no level exist remove class name in label with level in namedArea

ref #8889: sort taxonnodes for distribution editor on server side

ref #9354: add nodeDto to TaxonDistributionDTO

fix #9395 DerivedUnit.collectFieldUnits() as DerivedUnit.collectRootUnits() to return all types of root units - removig debug code

cleanup

fix #9395 DerivedUnit.collectFieldUnits() as DerivedUnit.collectRootUnits() to return all types of root units

ref #9356: adapt TypeDesignationComparator

ref #9332 re-organizing source(es) in TypeDesignation init-strategy

ref #7711: delete last media in galery should not delete description

fix #9387 extending init strategy

add javadoc comment

fix #9384, ref #9279 fixed incorrect implementation of createShortCitation and added tests

cleanup

TypedEntityReference: factory method with option to supress the label & using this in TypeDesignationSetFormatter

fixing inappropriate use of TypedEntityReference for creating tagged text in TypeDesignationSetFormatter

fixing NPE in RegistrationDTOController when identifier is not found

fix #9384 fixing author team truncation

ref #6591  adapt PESI import to new original spellings handling

cleanup

cleanup

ref #5573, ref #7612 adapt MediaSpecimenDefaultCacheStrategy to OccurrenceCacheStrategyBase

ref #5575 add first version of DnaSample cache strategy

ref #7612 a first (preliminary) version of MediaSpecimenDefaultCacheStrategy

cleanup and use TermTestBase for model tests

cleanup

uncomment RdfViewTest.testNameInformationRdf as it seems to work currently

cleanup

ref #9114 fix RdfViewTest

cleanup

ref #9114 further adapt jsonConfigurations and add new constructor to URI wrapper

ref #9114  adapt json mapping to new URI wrapper

ref #9114  adapt javadoc for new URI wrapper user type

cleanup

ref #9114  add toFile() to  URI to wrapper

ref #9114 add compareTo to URI wrapper

ref #9114 preliminary ignore RdfViewTest

cleanup

ref #9114 add URI Wrapper and replace all java.net.URI occurrences by the wrapper in cdmlib

cleanup

ref #9366 fix test in TypeDesignationSetManagerTest

fix #9366 add collection name to specimen titleCache if collection code does not exist

cleanup

ref #4770, ref #4908, ref #5163 remove commented line as it seems to work now

ref #4770, ref #4908, ref #5163 try to remove explicit setting of protected nomecncl. title in convertPerson2Team

ref #4770, ref #4908, ref #5163 some finetuning on convertPerson2Team

ref #4770, ref #4908, ref #5163 assert that team has protected nomenclatural title after convertPerson2Team

ref #4770, ref #4908 add test for person is null in person2Team converter

ref #4770, ref #4908 handle person is null in person2Team converter

ref #4770 handle unprotected titlecache for person2Team converter and some finetuning for empty persons

ref #4770 fix clone for AgentBase.contact

cleanup

cleanup

ref #4770 fix handling nomenclatural title for convertPerson2Team

improve generics for save() method

cleanup

try to fix failing test in suite (cont.)

ref #9349 add doRecursive to subtreeCloning

cleanup

try to fix failing test in suite (cont.)

ref #9349 rename newClassificationName method (cont.)

try to fix failing test in suite

ref #9349 rename newClassificationName method

cleanup

ref #9349 fix test for nomenclaturalStatus in name cloning

ref #9349 deprecate setReuseNames(false)

ref #9349 move cloneSubtree to taxonNodeService

remove deprecated methods from classificationService

cleanup

ref #9349 improve name cloning (including documentation as name cloning is not straight forward)

cleanup

move model comparators to own package