fix search for common names in editor and minor

 - added new test cases (still temporarily @Ignore)

 - fixed potential NPE

 - fixed potential NPE when adding taxon nodes for infra species

 - some code speed up
 - better default classification handling

 - fixed adding to default classification

 - temporarily added test to ignore

 - implemented new config option "Move new taxa to default classification"

 - added new config option "Move new taxa to default classification"
 - do not add associations for identifications with preferredFlag=false

 - enhanced report

 - enhanced ggbn parsing
 - enhanced report

 - added test to ignore temporarily

 - added test to ignore temporarily

 - fixed rank parsing
 - added deprecate annotation to config option

switching label and text in IdentifierType

last updates to eFlora import

add LSID and Alternative field number to Identifier Type vocabulary  #4708,  #4674

 - temp changes for name matching

moveTaxon() with uuids instead of objects as arguments

 - some name matching enhancements

 - reverted comment of test

 - added info messages to report
 - enhanced taxon name matching

latest updates to FotG import

type removed from SpecimenTypeParser

update to Markup import

minor

for infrageneric unranked rank adding [unranked] (Art.37.7 Melbourne Code)
fixing bug with deletion of names and homotypicalGroups

 - fixed name matching when ignoring authorship

 - fixed getTaxonForName()

 - added removeCountryFromLocalityText option to configurator (basically implementing the hack #4677)

 - shortened regex

 - fixed temporary geolocation hack

 - fixed java doc

 - fixed name matching when ignoring author

 - re-added temporary hack

 - removed temporary hack

 - fixed mapUnitIdToBarcode
 - fixed NPE for name parsing

 - added config option to choose mapping of ABCD UnitID
 - added config option to ignore authorship when matching taxa
 - added first draft of ggbn extension parsing

 - added ignoreAuthorship flag to ABCD import
  - when set to true taxon name matching will be done without the the authorship just on the nameCache of the NonViralName

 - reset all relevant dataholder fields for every unit

 - added methods to handle identifiers

 - fixed java doc

latest changes for Markup import

latest changes for Markup import

add NewInstance for Names in Determination Event

adadpt TimePeriodParser to include lifespan

minor

add some doubtful taxon relationships tom BM transformer

 - fixed paging for compressed specimen table

 - added pager to associated field units service method

minor

latest changes to Markup import

minor

moved flockSearch from checklistDemoController to TaxonController and renamed it to inlucdedTaxa

add UpdateResult and make DeleteResult a subclass

minor

adding missing statisticalValues to init strategy, related to #4639 (Show quantitative data correctly in Data portal (for Cyprus portal))

typo

add amplification cache test

change subtree param name

Add correct paging to findByIdentifier

allow streaming for PagerParams

fixing ambigious mvc controller mapping

fixing bug regarding taxon lsid in catalogue service

adding lsid to TaxonInformation

working on documentation and fixing include pattern for catalogue services

extended controller to enable feature export

DeleteResult : made serializable
remote-security : added remoting url intercept
remoting-services : made user service public
web.xml : added filter chain for securing remoting services

fix #4613

created new service in classificationService

it is a first draft of the createHierarchyService
based on taxonNames and until genus level.

 - check related objects for DeterminationEvents

 - fixed deletion result relates objects
 - removed @Ignore from tests

 - replaced instanceof with isInstanceOf()
 - replaced class cast expressions with deproxy

 - temporarily disabled tests to have jenkins compile

 - temporarily disabled tests to have jenkins compile

 - error handling for report file

 - only add the conflicting related objects to the DeleteResults

adding hand written documentation to the swagger ui and redirecting to doc/ automatically fromt the index page

remove lucene-core exclusion as it is already versioned

remove guava exclusion from swagger

PolytomousKey, PolytomousKeyNode : Added merge to cascade annotation
cdmlib-remote-servlet.xml, ConcurrentSessionTest.java : spelling checks
CdmCacher : made cache lement getter methods public
remoting-services.xml, httpInvokerServices : added new services

fixing swagger api-docs url

avoid LIE for subtree

make matchmode case insensitive in controller

for testing

add taxonNode to session in countByIdentifier

improve byIdentifer service

Rename mapping endpoint for findByIdentifier with subtree

change name of findByIdentifer in TaxonController

 - added @Ignore to failing test -_-

fixed

added excludes for swagger

 - added ABCD import test for subspecies