Corrected a minor mistake in the name cache strategy that led to incorrect display of authors when an autonym has a basionym author

Implemented hybrid formulars in cdmlib (parsing and caching)  #1517

minor

minor

PolytomousKeyNodeTest added

the deprecated methods call the new methods (#2176)

some work on the putXXX refactoring

Exception message for unestablished database connection.

added getNamedArea methods to Transformer classes and fixed bug with return type of getPersenceTermByKey. Logging for addSource for not ISourceable objects.

minor

improvements for looking up existing areas

change in label for endemic

adapt the all put/add methods operating on maps to put(key, value), set the old methods to deprecated

fixing comparing rank terms

fixing comparing rank terms

fixing comparing rank terms

bugfixes and new features for ferns

Corrected the failure output of an assertion

Corrected a path variable and wrote a test that checks if the variable is correct

harmonizing nameRelationship methods #2159

method name harmonization

upper case for JoinTable WorkingSet_DescriptionBase

remove duplicate for Argentina

Solved an issue where a reference with an uppercase word (e.g. SSSR) was not parsable

Solved an issue where a reference with an uppercase word (e.g. SSSR) was not parsable

remove duplicate for Argentina

including non-TDWG areas in BM occurrence import

change log level for unfound codes

toString improved

change logging for languageReference inconsistencies bugfix

check language reference integrity

added FIXME for missing named area vocabulary

change logging for languageReference inconsistencies

include "unknown" as language

bugfix for empty regionFks

check for RefDetail and RelPTaxon Notes

minor

minor

consistent representation for AZO and AZO-OO and SUR and SUR-OO

first step to refactor SDD import for large datasets

first step to refactor SDD import for large datasets

minor

dopping unique indexes for StateData and StatisticalMeasurementValue - modifiers  (#2025) and changing OneToMany -> ManyToMany for StatisticalMeasurementValue - modifiers (#2175)

minor

minor

minor

Removed DefinedTermBase.media OneToMany #560 (forgot to delete this line before)

removed FIXME for ManyToMany  #560

Changed DefinedTermBase.media form OneToMany to ManyToMany  #560

Fixes an issue where update of title caches did not work for cloned instances.

Use workingSet in SDD import  #2163

getComponentBeanName public and static

minor

minor

minor

Corrected the javadoc for putText(String, Language)

Failing tests set to ignore

updated javadoc for TextData.putText(XXX), #1515

javadoc for TaxonNameBase.clone()

Added clone() to all TaxonNameBase classes (including some descriptive and common classes). #2170

Refactoring of taxon business logic methods and started to write tests for these methods. The tests are far from finished.

adding taxontree id to the acceptedtaxa web service

remove compareTo in NamedArea and changed according tests

bugfix for cache updating hybrid flags

newInstance method for User

minor

add biliography to BM namefact categories

hybrid parsing and caching for monom, binom and trinom flags implemented

bugfix for partitioned deduplicate

use transformer for Cyprus and make base classes more generic for transformers

added PresenceTerm to transformers

marker type "endemic" and features "status" and "systematics" in cdmlib-persistence

marker type "endemic" and features "status" and "systematics" in cdmlib-model

latest changes for cyprus import

Deleted tests used for natural language and identification keys.

Last changes

Deleted tests used for natural language and identification keys.

Set up of the objects for the tests

ignore web accessing tests

openURL service wrapper implementation

minor fix

fixed setBarcode #2164

Created a test for the setBarcode method

minor

forget the ignore, it's getting too late :)

the test data did not make much sense before

Created a test to illustrate #2161

reference.uri from String to java.net.Uri (#2150)

Added new rank "unranked" (#2141) and updated language labels and titleCaches with full language name (#2144)

bugfix for term updates in imports that do not have a surrounding transaction

bugfix for long values in BMFacts

Fixed some problems in the point class

bugfix for jaxb annotation on isHashMapHibernateBugFixed

Implemented a uuidAndTitleCache method for institutions

Improved uuidAndTitleCache methods of ITaxonService

Corrected inheritance of interfaces. Corrected the message string of an exception.

Corrected the inheritance of service configurators

fixing test for release 3.0

move IdentificationKeyGenerator to cdmlib-model

Added comments