cleanup and remove ITaxonNameBase.getNomenclaturalCode

rename TaxonNameDefaultCacheStrategyTest

fix #8519 adding ROLE_USER_MANAGER to FirstDataInserter

ref #8505 adapting ApplicationConfiguration

ref #8517 DerivedUnitFacadeCacheStrategy handling protected FieldUnit title caches correctly

ref #8505 removing test code

ref #8505 making getCdmHomeSubDirFallback() static again

ref #1444, ref #8509 fix problems in TimePeriod mapping and toXXX method

ref #1444, ref #8509 add last action mapping

ref #1444, ref #8509 add DOI mapper

ref #1444, ref #8509 better handling of trim in mappers

cleanup

minor

fix #8513 removing MUST-EXIST file and getResourceFolderSeperator() method

ref #8505 renaming method to getResourceFolderSeperator() and adapting documentation

fix #8505 turning statical methods of ConfigFileUtil into non statical bean methods

ref #1444 Add TimePeriodMapper for Referece.year import

cleanup

ref #8488 Recurse sub types of term types

fix compile error

Exception handling in DbSingleAttributeExportMapperBase

minor

ref #8508 add uniqueResult methods to Source

ref #1444 add some ISO 639-3 languages for ERMS import

error handling in Language csv reading

cleanup and add new TermVocabulary.NewInstance method

ref #1444 handle truncated source.name (reference.titleCache)

cleanup

remove deprecated listRankSpecificRootNodes

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/5.9.0'

updating poms for branch'release/5.9.0' with non-snapshot versions

updating poms for 5.10.0-SNAPSHOT development

ref #8248 Minor fixes for session saving

ref #8441 remove cascading from FeatureState.feature and .state

avoid NPE in abcd import

smaller issues in Abcd import

ref #8248 Check existing feature/state of FeatureState during import

ref #8248 Adapt to new term node service

ref #8248 Fix import of character structure and property

Merge branch 'develop' of ssh://dev.e-taxonomy.eu/var/git/cdmlib into develop

SpecimenTypeDesignation representations for names

ref #8248 Import applicability feature states

ref #6774 export feature states

ref #6794 Fix endless loop in OWL export

ref #6794 Add progress monitor break point

ref #6794 Fix potential ClassCastException

adapt cdm light column names

fix NPE in setNomenclaturalSource

revert JAXB issues on NamedArea

cleanup

remove redundant JAXB parameters from NamedArea

ref #8479 add listUUIDs method

cleanup

improved logging for TaxonNode with missing sortIndex

ref #8479 propertyPaths fix for TermVocabulary

ref #8479 add concurrency, TaxonNodeOutStreamPartitionerConcurrent

ref #8479 ordering for taxon nodes implemented in TaxonNodeFilter and in loadById

ref #8479 propertyPaths for TaxonNodeOutStreamPartitioner and introduce interface ITaxonNodeOutStreamPartitioner

minor

ref #8385: label issues

ref #8299: CdmLightExportTable new column

ref #8299: add TypeCache and TypeString to homotypical group table

ref #8479 allow manual last commit for TaxonNodeOutStreamPartitioner

allow TaxonNodeOutStreamPartitioner to be readOnly = false and use in in CsvNameExport preliminary

cleanup

remove setRollbackOnly to test if this causes exception in TaxEditor tests. Also it looks like it should be used only in specific contexts

rename rollback method

cleanup

add rollback to ICdmRepository and use in TaxonNodeOutStreamPartitioner

cleanup

cleanup

ref #8180  ... and again try to fix the test data

ref #8180  ... and update test data in other projects

ref #8180  fix incorrect UUID in test data

ref #7600 add explict adders for adder and remover methods to EntityCollectionSetterAdapter

minor

ref #8479 make TaxonNode.addAgentRelation public and adapt remove method name

adapt CdmLightClassificationExport to hasXXX methods

ref #8180 Add vocabulary to test data

ref #8437 using TermType.getGeneralizationOf() to expand the termType restriction

add doubtful flag to TaxonNodeDto

cleanup

fix clone method for User

ref #8180 Add Presence state vocabulary to default terms

ref #8479 add hasXXX methods to TaxonNodeFilter

ref #8479 make TaxonNodeOutStreamPartitioner read only by default.

fix #8482 workaround fix for DescriptionType includes error

minor

add higher Taxon search option to specimen search

syntax for collective species uuid

minor

some minor adaptations to CdmLightExport and CsvNameExport

minor

fix #8480 Use DescriptionTypes in descriptive data set service

add preference predicates

ref #8432 adapt javadoc

ref #8432 adapt TermTreeDaoImpl.load such that default feature tree is only created and returned if the default feature tree uuid is passed to it