Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/4.5.0'

updating poms for branch'release/4.5.0' with non-snapshot versions

updating poms for 4.6.0-SNAPSHOT development

fix #6342: fix exception for ? in selection dialog

ref #6339 reducing code duplication

Initialise sample designation to format keys for IdentifiableEntity

fix #6339 fixing missing respect to the frontendBaseUrl

ref #6248 also protecting /**description/accumulateDistributions

ref #6249 prefixig all logappender with instance (bean) name for EnhancedPatternLayout

fix #6248 implementing global management users for machine clients

minor code cleaning

removing unused and misleading method

ref #6118 enabling missing httpbasic authentication for oauth secured endpoints

cleaning up CdmUtils
   - removing usused method
   - reducing code duplication

fix #4223 using the ComplexPhraseQuery for phrase searches with wildcards

ref #6158 Update source code repository from svn to git

fix #6227 solvig LIE in DerivedUnitFacade webservice

ref #6301 extending media objects returned by MediaListController
 - adding sources

fix #4377 adding missing bean init path missing after ref #5974

ref #6324 adding FIXME comment

fix #6323 adding missing bean init path missing after ref #5974

ref #6320 Add pherogram title cache to format keys

Add new English quotation marks

cleanup

some code cleaning

fix #3465 Progressmonitor API and better UpdateResult handling for setSecundumForSubtree

fix #6317 fixing LIE related to inReference author teams

un-commenting test part

ref  #6296: minor

ref  #6296: minor

fix #6296: include the common name search into the search query of taxa and synonyms

cleanup

fix #3465 implement setSecundumForSubtree

fix  #6299: add openSession in getSession when there is no current session

ref #6190 removing svn property place holder in first line of code - java files

minot

missing changes for repair methods and cdmPreferences in editor

ref #6190 removing svn property place holder in first line of code

fix #6249 prefixig all logappender with instance (bean) name and disabling per instance log files

minor to fix the failing test

fix #6268 initializing decriptions of media entities for portal webservices

ref #6283: minor changes to fix exceptions in polytomous key editing

fix #6261 searching all superclasses for generic type arguments in base controller

ref #6283: fix NPE exceptions caused by null values in children list

minor

minor

extend biocase import

extend excel import for tropicos

fix #6274: add an update for childrenCount cache if count of children not the same as the cache

ref #5762 Rights to be reusable, still need to update existing unique

cleanup

ref #3934  add department to NamedAreaLevel

cleanup

cleanup (including deprecated methods in Media)

ref #4766: prepair the sortindex updater for calling via IOService

Cleanup and new Rights Factory method

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

Updating develop poms to hotfix version to avoid merge conflicts

Merge branch 'hotfix/4.4.1'

updating poms for branch'hotfix/4.4.1' with non-snapshot versions

ref #6248 disabling authorization restriction on /manage/ as temp workaround

fix #6244: add removeNullValues in updateSortindex method to avoid exception when collection contains null values

updating poms for 4.4.1 branch with snapshot versions

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/4.4.0'

updating poms for branch'release/4.4.0' with non-snapshot versions

updating poms for 4.5.0-SNAPSHOT development

fix SortIndexUpdater bug for missing @id replacement

fix #4594 fix includeEntity issue for findByMarker and findByIdentifier methods

fix #6135 allow nameCache for merked taxa search

cleanup

fix #6236 add alphabetic length ordering to name search

ref #6128  fix null value bug for includeAuthorship

fix #6134 add group taxa by marker and refactor treeindex handling

Cleanup

fix failing test

fix #6128 include authorship option in taxon and name search

Cleanup and replace int by long in count

fix #6132  first implementation of parent taxon in TaxonInContextDTO

add getIdentifierType to IO Transformers

Cleanup

Revert "updating poms for 4.5.0-SNAPSHOT development"

This reverts commit 9ff0eb6731c1b854d6bea082b5bd87e001b202bd.

reverting version to 4.4.0-SNAPSHOT

ref #2985 portal controller for named areas

updating poms for 4.5.0-SNAPSHOT development

ref #2985 fixing init strategy to add the gateringEvent.collectingAreas

ref #2985 controller method to return extensions with type and solving probelm with pagin of sets in generic controller

ref #6211 cleanup old code

cleanup

fix #6122 use StringResultDTO for titleCache service

doc

cleanup

ref #6211 avoiding to deep initialization of synonym groups

fix #6211 fix API incompatibility