fixing bug in loadRankSpecificRootNodes

minor change on comment

Workaround for out of memory issues: Added logic to split the amount of taxa to be saved into small groups (similar to fauna europaea import).

Added 'limitSave' to set/get an upper limit amount of taxa to be saved at once (similar to fauna europaea configurator).

missing parent pom.xml for c3p0 [change sets: 8000, 8002]

removed System.err.println()

removed System.err.println()

removed System.err.println()

removed system.err.println()

removed system.err.println()

fixing jet another LazyLoadingException

preparing for hibernate-c3p0 & removing out all System.err.println & avoiding proxy narrow log of hibernate

improving loadRankSpecificRootNodes

preparing for hibernate-c3p0 & commenting out all System.err.println

improving loadRankSpecificRootNodes

improving loadRankSpecificRootNodes

removed citations feature from palmae feature tree (was a duplicate)

Search in Taxonomic Editor runs in it's own thread now.

Added citations feature to palmae feature tree

added service to get all taxon nodes

fix the jaxb import/export

while unmarshalling the xml escaping has to be reversed

Added setter/getter for TaxonNamePropertyPath

Added setter/getter for TaxonNamePropertyPath

Handle errors in Excel file

Using newly added TaxonNamePropertyPath

Handle errors in Excel file

Handle errors in Excel file

an & in the xml lead to errors during parsing

an & in the xml lead to errors during parsing

XmlHelp munched exceptions. That is not very helpful.

windows installation files

new folder structure for installers

new folder structure for installers

minor

matching is now configurable in the editor

minor

moved image functionality into the library

moved image functionality into the library

fixes #1407

Latest TaxonX files for palms import added

Added WorkingSetDao & Service

Added WorkingSetDao & Service

Changes to NonViralName.getTitleCache()

getMatchMode() in DefaultMatchStrategy is now failsafe

moved functionality from editor to library

shorter timeout for metadata service

mini fix

allowing to write

FeatureTreeService now returns a default FeatureTree when no tree is in database. Testing it with portal now.

Added constraints to Taxon.synonymRelations, Synonym.synonymRelations, and SynonymRelationship.relatedFrom & SynonymRelationship.relatedTo to mark orphaned synonyms as invalid. [https://dev.e-taxonomy.eu/trac/ticket/1347]

Also, added constraint such that two accepted names or an accepted name and a synonym with the same sec reference and the same name are invalid.

Added constraints to Taxon.synonymRelations, Synonym.synonymRelations, and SynonymRelationship.relatedFrom & SynonymRelationship.relatedTo to mark orphaned synonyms as invalid. [https://dev.e-taxonomy.eu/trac/ticket/1347]

Also, added constraint such that two accepted names or an accepted name and a synonym with the same sec reference and the same name are invalid.

Trace

Trace v2

Trace

test commit

in xml file taxonnode is referenced by id
#1277 jaxb import

#1277 jaxb import, set id to @XmlTransient

#1277 jaxb import

Added isDatabaseSchemaCompatible().

Added isDatabaseSchemaCompatible().

Corrected bug in AuditEventDao

management service (/manager/datasources/*) ( and management page (/index.jsp)

improving datasource management

new test for the delete method of TaxonNameDao

implement the delete method, to delete the refering taxonbases #1390

Added protected setter methods to Synonym.synonymRelations and Taxon.relationsToThisTaxon to allow bean initialization

#1279

#1279

minor change

fixed bug in listDescriptions

Updated cascade sematics for determinations

#1390

#1390

#1390

Preparatory work for ticket #1347.

Preparatory work for ticket #1347.

Preparatory work for ticket #1347.

fixes #1365 and #1366

Allowed replace(T x, T y) to accept null for the second argument and globally replace x with null or remove x from collections

Altered ReferringObjectMetadataFactoryImpl to exclude bidirectional relationships where the replaced entity is the "owner" of the related entity (i.e. the relationship is mapped by @OneToMany & mappedBy != null) since those kind of relationships don't make sense in the context of a global replace method.

Implemented a new method to return taxon relationships that are between two taxa.

fixes #1357

Updated ICdmEntityDao replace(T x, T y) and refresh(T t, LockMode lockMode, List<String> propertyPaths) and added methods to IAnnotationDao

Updated ICdmEntityDao replace(T x, T y) and refresh(T t, LockMode lockMode, List<String> propertyPaths) and added methods to IAnnotationDao

On behalf of Niels: Check for multiple parents changed in addParentChild()

fixes #1343

fixes #1022

fixes an issue with bulk adding of taxon nodes to a taxonomic tree