merge for groups has to check for existing and changed authorities before merge the group

emall fix for selection of reference as inreference

ref #6401 Upgrade jetty plugin to support j1.8

ref #6401 temporarily remove uuids from MarkupTransformer to allow compiling

ref #6401 Improve generics for TypeDesignationStatusBase and RelationshipTermBase

ref #6401 fix compilation errors in OrderedTermBaseTest

ref #6401 fix failing SecurityTest (due to wrong handling of furtherVotingResult in CdmPermissionVoter

ref #6401 better distinguish IdentifiableEntity.compareTo from DefinedTermBase.compareTo

 * this is to avoid jumping to IdentifiableEntity.compareTo if DefinedTermBase.compareTo does not match generics exactly

Cleanup

ref #6401  revert maven compiler plugin version as it leads to failing tests (probably related to aspectj issues and maybe others)

ref #1606 fix bug in referenceDao.getUuidAndTitleCache

Cleanup

ref #6392 ref #6374 fixing markerType filter was ignored

ref #6401 Fix problems with generics due to jdk1.8

ref #6401 Updated cdmlib to jdk1.8

 - Had to increase the parser stack size to avoid StackOverflow when
parsing large java classes
  - https://maven.apache.org/plugins/maven-compiler-plugin/compile-mojo.html#compilerArgs
  - http://stackoverflow.com/questions/29984739/stackoverflowerror-java-1-8

fix #1606: minor

fix #1606: add generic type to all filters

ref #1606: add methods to provide filter for reference type

fix #4390: add missing check for protected titleCache

fix #4390: update titlecache only for SpecimenOrObservationBase entities

fix #4390: update titlecache for all merged identifiableEntities

ref #6362 remove further occurrences of NonViralName

fix #6398 messing up and harmonizing description related taxon service endpoints

removing unused method which was created for palmweb

ref #6365 use TaxonNameFactory for static parser methods

ref #6365 use TaxonNameFactory for botanical names

ref #6365 use TaxonNameFactory for zoological names

fix #6360 use TaxonNameFactory for NonViralNames

fix #6364 use TaxonNameFactory for viral and bacterial names

fix #6366 use TaxonNameFactory for cultivar names

ref #6362 remove some further NVN occurrences

ref #6365 Move zoological parse methods to TaxonNameBase

Remove isCodeCompliant from TaxonNameBase

ref #6366 move cultivar attributes and functions to TaxonNameBase

cleanup

ref #6365 merge static methods from BotanicaName to TaxonNameBase

ref #6365  ref #6360 ref #6364 replace taxon name factory methods

ref #6365 replace ZoologicalName factory methods

ref #6360 replace NonViralName factory methods

ref #6365 Move all ZoologicalName attributes up to TaxonNameBase

ref #6364 Move all BacterialName attributes up to TaxonNameBase

ref #6364 Move all ViralName attributes up to TaxonNameBase

minor

fix #6393 enabling manage services to be accessed via ajax with authentication

ref #6369 adapt existing occurrences of interface to removed generics

ref #6369 remove generics from interfaces

fix #6369 add interface for all names

ref #6369 add IViralName interface

ref #6369 add remaining interfaces

ref #6362  removed some NonViralName occurrences (make it compiling again)

ref #6369 Add interfaces for TaxonNameBase and NonViralName

cleanup

ref #6362  removed some NonViralName occurrences (non-compiling as changing in model are still missing)

fix #6382 proper handling of authentication in cdm_ws_progress.js

Revert "Revert "ref #6369 Add interfaces for TaxonNameBase and NonViralName""

This reverts commit 949c09b142f2806539e3fb399bef980d3e17e293.

Revert "Revert "fix #6360 moved all NonViralName functionality to TaxonNameBase""

This reverts commit 9b9d0a956d78e3aec1024bc0a5fa33f33e5b33aa.

minor

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

Updating develop poms to hotfix version to avoid merge conflicts

Merge branch 'hotfix/4.5.1'

updating poms for branch'hotfix/4.5.1' with non-snapshot versions

Merge branch 'develop' into hotfix/4.5.1

updating poms for 4.5.1 branch with snapshot versions

Revert "fix #6360 moved all NonViralName functionality to TaxonNameBase"

This reverts commit 7d8c96134bda3c11d053df2e8e5d03f32a500ee3.

Revert "ref #6369 Add interfaces for TaxonNameBase and NonViralName"

This reverts commit 1e42628a4c24232f9b03a2a1e508d7cd79e0e0ba.

code cleaning

Fix potential NPE when there is a facade with no derived unit

fix #6373 fixing MediaAutoInitializer

revert last minor change in misapplied name search

minor

fix tests

ref #6296 confirming that modified expectations are correct, removing FIXMEs

fix #6296: fix the parameter settings in search queries

ref #6296 more tests for findByTaxaAndName

fixing createTestData - applying manual additions from xml dataset

splitting TaxonService search tests for freetext and standard search - all enabled test cases are successful by now

minor refactoring of TaxonServiceSearchTest

ref #6369 Add interfaces for TaxonNameBase and NonViralName

fix #6360 moved all NonViralName functionality to TaxonNameBase

fix #2501 remove redundant SDD import class

minor

ref #6354 additinonal test for non phrase queries

fix #6354 non phrase search with wildcard using the standart QueryParser

fix #6296: fix problems for simple search

add test for different search combinations

fixed copy paste error for common name search

Updating develop poms back to pre merge state

Merge branch 'master' into develop

updating develop poms to master versions to avoid merge conflicts

Merge branch 'release/4.5.0'

updating poms for branch'release/4.5.0' with non-snapshot versions

updating poms for 4.6.0-SNAPSHOT development

fix #6342: fix exception for ? in selection dialog

ref #6339 reducing code duplication

Initialise sample designation to format keys for IdentifiableEntity

fix #6339 fixing missing respect to the frontendBaseUrl

ref #6248 also protecting /**description/accumulateDistributions

ref #6249 prefixig all logappender with instance (bean) name for EnhancedPatternLayout

fix #6248 implementing global management users for machine clients