Add find- and countByTitle() methods to primer and amplification service
[cdmlib.git] / cdmlib-services / src / main / java / eu / etaxonomy / cdm / api / service / IClassificationService.java
index a9793f8c336f6c0b696af93f47df4b6d2e0c9d07..4be48af59b7e0d15cdc505f73b4f83acf784e280 100644 (file)
@@ -15,20 +15,21 @@ import java.util.List;
 import java.util.Map;
 import java.util.UUID;
 
-import eu.etaxonomy.cdm.model.common.UuidAndTitleCache;
+import eu.etaxonomy.cdm.api.service.config.CreateHierarchyForClassificationConfigurator;
+import eu.etaxonomy.cdm.api.service.pager.Pager;
 import eu.etaxonomy.cdm.model.media.MediaRepresentation;
 import eu.etaxonomy.cdm.model.name.Rank;
-import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.ITreeNode;
+import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.Classification;
+import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.ITaxonTreeNode;
 import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.Taxon;
 import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.TaxonNode;
-import eu.etaxonomy.cdm.model.taxon.Classification;
+import eu.etaxonomy.cdm.persistence.dto.UuidAndTitleCache;
 import eu.etaxonomy.cdm.persistence.query.OrderHint;
 
 
 /**
  * @author n.hoffmann
  * @created Sep 21, 2009
- * @version 1.0
  */
 public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Classification> {
 
@@ -44,7 +45,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @param uuid
      * @return
      */
-    public ITreeNode getTreeNodeByUuid(UUID uuid);
+    public ITaxonTreeNode getTreeNodeByUuid(UUID uuid);
 
     /**
      *
@@ -65,6 +66,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @deprecated use loadTaxonNode(TaxonNode taxonNode, ...) instead
      * if you have a classification and a taxon that is in it, you should also have the according taxonNode
      */
+    @Deprecated
     public TaxonNode loadTaxonNodeByTaxon(Taxon taxon, UUID classificationUuid, List<String> propertyPaths);
 
     /**
@@ -74,6 +76,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @return
      * @deprecated use TaxonNodeService instead
      */
+    @Deprecated
     public TaxonNode loadTaxonNode(TaxonNode taxonNode, List<String> propertyPaths);
 
     /**
@@ -86,10 +89,53 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      *
      * @param classification may be null for all classifications
      * @param rank the set to null for to get the root nodes of classifications
+     * @param limit The maximum number of objects returned (can be null for all matching objects)
+     * @param start The offset from the start of the result set (0 - based, can be null -
+     *                 equivalent of starting at the beginning of the recordset)
+     * @param propertyPaths
+     * @return
+     * @deprecated use {@link #listRankSpecificRootNodes(Classification, Rank, Integer, Integer, List)} instead
+     */
+    @Deprecated
+    public List<TaxonNode> loadRankSpecificRootNodes(Classification classification, Rank rank, Integer limit, Integer start, List<String> propertyPaths);
+
+
+    /**
+     * Loads all TaxonNodes of the specified classification for a given Rank or lower.
+     * If a branch of the classification tree is not containing a TaxonNode with a Taxon at the given
+     * Rank the according node associated with the next lower Rank is taken as root node in this case.
+     * So the nodes returned may reference Taxa with different Ranks.
+     *
+     * If the <code>rank</code> is null the absolute root nodes will be returned.
+     *
+     * @param classification may be null for all classifications
+     * @param rank the set to null for to get the root nodes of classifications
+     * @param pageSize The maximum number of relationships returned (can be null for all relationships)
+     * @param pageIndex The offset (in pageSize chunks) from the start of the result set (0 - based)
      * @param propertyPaths
      * @return
+     *
      */
-    public List<TaxonNode> loadRankSpecificRootNodes(Classification classification, Rank rank, List<String> propertyPaths);
+    public List<TaxonNode> listRankSpecificRootNodes(Classification classification, Rank rank, Integer pageSize, Integer pageIndex, List<String> propertyPaths);
+
+
+    /**
+     * Loads all TaxonNodes of the specified classification for a given Rank or lower.
+     * If a branch of the classification tree is not containing a TaxonNode with a Taxon at the given
+     * Rank the according node associated with the next lower Rank is taken as root node in this case.
+     * So the nodes returned may reference Taxa with different Ranks.
+     *
+     * If the <code>rank</code> is null the absolute root nodes will be returned.
+     *
+     * @param classification may be null for all classifications
+     * @param rank the set to null for to get the root nodes of classifications
+     * @param pageSize The maximum number of relationships returned (can be null for all relationships)
+     * @param pageIndex The offset (in pageSize chunks) from the start of the result set (0 - based)
+     * @param propertyPaths
+     * @return
+     *
+     */
+    public Pager<TaxonNode> pageRankSpecificRootNodes(Classification classification, Rank rank, Integer pageSize, Integer pageIndex, List<String> propertyPaths);
 
     /**
      * @param taxonNode
@@ -130,16 +176,12 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
 
 
     /**
-     * Although this method seems to be a redundant alternative to {@link #loadChildNodesOfTaxonNode(TaxonNode, List)} it is an important
-     * alternative from which web services benefit. Without this method the web service controller method, which operates outside of the
-     * transaction, would have to initialize the full taxon tree with all nodes of the taxon.
-     * This would be rather slow compared to using this method.
-     * @param taxon
-     * @param classification
+     * @param taxonUuid
+     * @param classificationUuid
      * @param propertyPaths
      * @return
      */
-    public List<TaxonNode> loadChildNodesOfTaxon(Taxon taxon, Classification classification, List<String> propertyPaths);
+    public List<TaxonNode> listChildNodesOfTaxon(UUID taxonUuid, UUID classificationUuid, Integer pageSize, Integer pageIndex, List<String> propertyPaths);
 
     /**
      * @param taxonNode
@@ -147,6 +189,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @deprecated move to TaxonNodeService
      * @return
      */
+    @Deprecated
     public List<TaxonNode> loadChildNodesOfTaxonNode(TaxonNode taxonNode, List<String> propertyPaths);
 
     /**
@@ -165,9 +208,11 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @param widthOrDuration
      * @param mimeTypes
      * @return
-     *  @deprecated use getAllMediaForChildNodes(TaxonNode taxonNode, ...) instead
+     *
+     * @deprecated use getAllMediaForChildNodes(TaxonNode taxonNode, ...) instead
      * if you have a classification and a taxon that is in it, you should also have the according taxonNode
      */
+    @Deprecated
     public Map<UUID, List<MediaRepresentation>> getAllMediaForChildNodes(Taxon taxon, Classification taxTree, List<String> propertyPaths, int size, int height, int widthOrDuration, String[] mimeTypes);
 
     /**
@@ -188,6 +233,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @return
      * @deprecated use TaxonNodeService instead
      */
+    @Deprecated
     public UUID removeTaxonNode(TaxonNode taxonNode);
 
     /**
@@ -196,6 +242,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @return
      * @deprecated use TaxonNodeService instead
      */
+    @Deprecated
     public UUID saveTaxonNode(TaxonNode taxonNode);
 
     /**
@@ -204,6 +251,7 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @return
      * @deprecated use TaxonNodeService instead
      */
+    @Deprecated
     public Map<UUID, TaxonNode> saveTaxonNodeAll(Collection<TaxonNode> taxonNodeCollection);
 
     /**
@@ -211,17 +259,20 @@ public interface IClassificationService extends IIdentifiableEntityService<Class
      * @param treeNode
      * @return
      */
-    public UUID removeTreeNode(ITreeNode treeNode);
+   
+    public UUID removeTreeNode(ITaxonTreeNode treeNode);
 
     /**
      *
      * @param treeNode
      * @return
      */
-    public UUID saveTreeNode(ITreeNode treeNode);
+    public UUID saveTreeNode(ITaxonTreeNode treeNode);
 
 
     public List<TaxonNode> getAllNodes();
 
+       public UpdateResult createHierarchyInClassification(Classification classification, CreateHierarchyForClassificationConfigurator configurator);
+
 
 }