ref #6026 solving problems in date and specimenType parsers, also implementing tests

ref #6035 adding more character fixed and adding source referenence for all names

ref #6026  'Coll. Lange-Bertalot..' as titleCache of Collection

ref #6026 using genera as higher taxon for species

fix #6068

ref #6026 3 more character replacement rule

ref #6026 fixing rank

ref #6026 fixing bug in publication regex pattern

ref #6026 speedup of import and fixing a minor bug
   - speedup by special handling for hardly to parse reference
   - minor bug during camparison of basionym names

ref #6026 keepgin deteced ref type in case of 'Vorabdruck'

ref #6026 NameTypes (with minor problems)

ref #6026 FieldUnit locality working

removing unused repo from the pom.xml (was used for yourkit)

minor

fix #5893: fauna europaea reference import with more atomized data

#5448 Imporve name check for multiple ex authors

#5448 Improve import of families
 - clone families for checklist
 - load in related objects method

#5448 Change abbrev label of unranked infraspecfic rank before importing

ref #5448 Reduce multiple ex authors to only two

ref #5448 Reduce multiple ex authors to only two

adaption to specimen import changes

#5448 Fix import of hybrid formula

ref #5448 code cleanup

#5448 Refactor hybrid name import/check

#5448 Use SEQNUM as id column
 - enhance hybrid name check

#5448 Import genus hybrid formulas

#5448 Support corner cases
 - SPI and KMB as ranks
 - nomenclatural status type
 - HYB name checking

#5448 Handle rank "SPI"

#5448 Import non-CDM ranks

#5448 Remove non-exisiting hybrid category

#5448 Import HYB 'nf'

#5448 Import rank "SAM"

#6000 Use new CASUAL Method instead of deprecated INTRODUCED_ADVENTITIOUS

#5448 Add "distinct" to SQL query as family table contains duplicate
rows

#5488 Improve import of family taxa
 - Load families in related object methods

#5448 Fix hybrid import where specific epithets are not from same genus

#5448 Add family rank

#5448 Fix hybrid import where specific epithets are not from same genus

ref #6026 handling 'Vorabdrucke' as Book Volume/Issue

ref #6026 support for making statistics on parsed type data - typo

ref #6026 importing Basionyms

ref #6026 support for making statistics on parsed type data:
Type parsing statistics:
 - Type: field 'Type' can not be parsed (parse problem of whole typeString)
 - Type: fielUnitStr can not be parsed (parse problem of fielUnitStr)
 - Type: Could not parse specimen (parse problems in holotype, isotype)

ref #6026 better type parsing
  - FieldUnit: collector, fieldnumber, date
  - Specimen: Collection, Subcollection, accession number
Does not work in all cases

ref #6026 two more date parsing rules

ref #6026 type parsing
   - parsing of specimen types

ref #6026 publication date parsing completed

ref #6009 improved plublication date parsing
   - all dates recognized
   - all months recognized
   - special time spans not implemented (Winter, Fall, April-June, etc)

ref #6009 improved plublication date parsing

ref #6035 more character replacement rules

fix #6035 character replacement rules

removing unused code

Alternative data files

ref #6026 first basic import of types

ref #6026 multiple improvements
  - better ranks for incertis sedis and old Classes
  - Caveats as annotations

ref #6026 multiple improvements
 - importing notes as annotations
 - improved rank guessing
 - solving performance problems related to classification root node
 - better tilecache and  nameCache plausibility checks

ref #6026 multiple improvements
  - better handling of fossil taxa
  - Authors spelling as misspellings
  - fix related to publication year
  - "Author abbreviation not checked" as annotations

#6026 import of taxa and names working

Fixing strange dependency problem related to spring-orm version

Initial set of classes for the IAPT import

removing build.xml

gitignore

Fixing repository settings and project group id

#5448 Pass rank and nomenclatural code to name parser creation

#5448 Import hybrid with more than 2 parents with protected titlecache

#5448 Add missing ranks to transformer

#5448 Enhance taxon name check

#5448 Fix import of families

#5448 change DB table name

#5448 Fix import of hybrids due to merge conflicts

#5448 Fix potential NPEs

#5448 Fix title cache and LIE issues

#5448 Import cultivar as CultivarPlantName

#5448 Add taxa to their respective families

#5448 Import families

#5448 javadoc

#5448 Fix possible NPE

#5448 Avoid clonig of all taxa for all classifications

#5448 Save concept relations

#5448 typo

#5448 Set species epithet for species groups and aggregates

#5448 Move import of concept relationships to classification import
class
 - there we already have the accepted taxa for the synonyms

#5448 Import annotation infos
 - hybrid formula
 - ehrd, atlas, kart, flor, rl2015, wissk

#5448 Set meaningful reference names

Small additions to import
 - import nomenclatural status extra information to ruleConsidered
 - refresh title cache of taxa to correctly display sec ref
 - advanced title cache consistency check
 - import common name with german language

Adapt cdmlib-app poms to new version

#5958 fix findByName in pesi

#5958 fix findByName in pesi

#5822 / #5892  Mexico rubiaceae import

Update eflora and pesi to v4.2.0

#5791 Adapt type of E+M vocabulary.

Add missing nomenclatural status and taxon relations to transformer
#5448

Add missing taxa to related objects #5448

Cleanup poms in cdmlib-app

Add id_1 mapping to mexico

Update cdmlib version

Fix ClassCastException, improve taxon name check, fix rank evaluation
#5448

Update to mexico import #5822 / #5892

Import synonyms of other classifications #5448

Set sec reference for all taxa #5448

minor